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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 程序语言 » Python » 在线求助文件格式怎么转换
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MeNg、

新虫 (小有名气)

[求助] 在线求助文件格式怎么转换

把genbank文件格式转换成fasta文件格式的python代码怎么写

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1楼2019-07-19 23:29:16
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莫问伯言

铁杆木虫 (正式写手)
★
jjdg: 金币+1, 感谢参与 2019-07-23 06:32:07
biopython

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2楼2019-07-20 11:12:35
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MeNg、

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 莫问伯言 at 2019-07-20 11:12:35
biopython

就是不会用biopython 大神可以教教嘛

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3楼2019-07-20 16:22:25
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莫问伯言

铁杆木虫 (正式写手)
★
jjdg: 金币+1, 感谢参与 2019-07-23 06:32:56
引用回帖:
3楼: originally posted by meng、 at 2019-07-20 16:22:25
就是不会用biopython 大神可以教教嘛
...

from bio import seqio
for seq_record in seqio.parse("ls_orchid.gbk", "genbank" ):
    print seq_record.id
    print seq_record.seq
    print len(seq_record)
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4楼2019-07-21 22:06:27
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MeNg、

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 莫问伯言 at 2019-07-21 22:06:27
from Bio import SeqIO
for seq_record in SeqIO.parse("ls_orchid.gbk", "genbank&quot:
    print seq_record.id
    print seq_record.seq
    print len(seq_record)...

厉害厉害 大神还在不 想请教问题 能要您个微信不

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5楼2019-07-22 00:18:49
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