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jefflcw

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教关于氢键强弱的表示参数问题

我不是学计算机专业的,对于这QSAR方面的问题不太懂。想请教各位,我看了文献,要描述分子形成氢键的强弱可以用最低轨道占有能(ELUMO),原子电荷(atomic charges)以及分子静电势(molecular electrostatic potential)来表示,不知道原子电荷还有分子静电势到底是怎么计算的哦?
是用软件吗还是公式?

请教高手,谢谢!

[ Last edited by cadick on 2009-12-14 at 03:58 ]
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jefflcw

金虫 (小有名气)

呵呵,让你见笑了。确实不太搞得懂。

你的意思是有专门的软件可以计算出分子静电势和原子电荷吗?

可不可以把它们的计算公式找出来,然后直接代入计算呢?
3楼2009-05-26 15:54:56
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢! 5-27 07:07
QSAR 不是学计算机专业的人搞的吧,呵呵……

你所提到的那些通常都是通过软件计算出来的。这方面的文章很多,搜一些看看就是了……
2楼2009-05-26 14:57:10
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
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zeoliters(金币+2,VIP+0):感谢提供资源! 5-26 13:06
这个,关于量子化学类的描述符在 QSAR 中的应用,可以看一篇比较老的,但较全面的文献
CODE:
@ARTICLE{CR_1996_Karelson,
    author = {Karelson, M. and Lobanov, V. S. and Katritzky, A. R.},
    title = {Quantum-chemical descriptors in {QSAR}/{QSPR} strudies},
    journal = {Chemical Reviews},
    year = {1996},
    volume = {96},
    number = {3},
    pages = {1027-1043}
}

[ Last edited by snoopyzhao on 2009-5-26 at 17:31 ]
4楼2009-05-26 17:29:51
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maomao1210

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
mingdong(金币+3,VIP+0):感谢交流! 8-15 13:37
假设你要计算分子CO的分子的静电势。静电势是一个场,是对空间的函数。我们假定空间中某点 R1 的静电势为V(R1)= Zc/R1c+Zo/R1o- Integr{density(R2)/R12}dR2
density(R2)是电子的密度函数,对全空间积分。不知道能明白我的意思不?那么这么计算出来的就是CO分子在空间R1处的静电势了。R1c 是该点与C的距离,R1o是该点与O的距离, R12是电子与该点的距离。不知道能否给几个金币?实在揭不开锅了。。。。。。。。。。如还有不明白的地方可以进一步详谈。。。。
5楼2009-05-26 19:50:53
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