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xiaojie7783

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】killed by signal(解决)

你好,我用VASP计算能带结构的时候,首先进行非自洽的并行计算,但是总是计算到一会就被退出来了,输出文件里这么显示:
rank 0 in job 1  compute-1-14.local_33718   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 0: killed by signal 9
  这是怎么回事呢?上网也看不到解答,急求高手帮忙解答一下,谢谢了!

[ Last edited by xiaojie7783 on 2009-11-20 at 09:54 ]
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hakuna

木虫 (知名作家)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wuchenwf(金币+2,VIP+0):xiexie 6-1 00:09
这问题比较复杂,你优化时是否也是这样?
用的是INTEL的U的话,当k点多了或体系大时,会出现类似问题,这时可能遇到了通讯瓶颈,AMD的U一般不会有此问题。
另外,编译时,换一下函数库看看,libgoto的库很快,但会遇到与此类似问题。你可以提交作业后,观察一下内存占用的变化,如果内存占用一直增加,直到占满后作业自杀,那就换函数库,重新编译吧
最后,查一下你给的结构是否合理,如果不合理,也会遇到类似问题
2楼2009-05-31 09:55:55
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xiaojie7783

金虫 (小有名气)

谢谢你的回答 我的POSCAR文件写错了 可能是这个的原因吧
成功其实很简单,就是当你坚持不住的时候,再坚持一下!
3楼2009-06-03 14:05:09
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liluyan

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我的也遇到了同样的问题,不知道怎么回事,求助啊
4楼2009-06-09 09:34:41
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xiaojie7783

金虫 (小有名气)


wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 6-11 23:57
我的现在好了 是POSCAR写错了 导致晶体结构出错 你再看看你的结构 楼上的
成功其实很简单,就是当你坚持不住的时候,再坚持一下!
5楼2009-06-09 09:42:12
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liluyan

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我的POSCAR没有问题的,改用别的IBRION=2就可以算得,但是总是出错,不知道怎么回事
6楼2009-06-11 11:09:41
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