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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 转基因 » lncRNA和miRNA测序结果与参考基因组比对效率低的问题
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不二玉

新虫 (初入文坛)

[交流] lncRNA和miRNA测序结果与参考基因组比对效率低的问题

公司返回的结果，lncRNA和miRNA测序结果与参考基因组比对效率都比较低，只有40%左右，基因组数据用的是phytozome上的。
请问这种比对结果还能做后续的分析吗？
phytozome上的基因组数据可靠吗？
这种情况有什么解决办法吗？
后面应该做什么怎么做完全不知道了........
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1楼 2019-07-03 10:38:07
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不二玉

新虫 (初入文坛)
求助
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2楼2019-07-25 18:14:40
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他山石01

新虫 (小有名气)
重复效果不好也会影响差异基因分析

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3楼2019-08-02 14:35:45
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不二玉

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 他山石01 at 2019-08-02 14:35:45
重复效果不好也会影响差异基因分析

问题是每个重复的比对效率都不高啊
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4楼2019-08-20 15:51:23
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