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木虫 (著名写手)

[求助] 16S鉴定问题求助

1492R方向测序没有问题,27F测序遇到套峰,现在选了1-2个样从1492方向合成中间引物继续测,没有套峰了。基本确定样品是什么种属。问题是,如果发表论文以及传序列到Ganbank等,只提供1492方向的测通的没有套峰的测序结果,不提供27F有套峰的测序结果,行不行?测序公司建议继续纯化菌株再重新提取DNA进行PCR和测序,要不要这么做?不做会影响毕业论文和发表论文吗?
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为什么
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tjw0824

木虫 (著名写手)

可以采用ta克隆,有些菌株的16s就是套峰

发自小木虫Android客户端
tttt
2楼2019-06-24 22:50:17
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547star

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tjw0824 at 2019-06-24 22:50:17
可以采用ta克隆,有些菌株的16s就是套峰

克隆比较麻烦,一定要测27F吗?从1492这边测通不行?
为什么
3楼2019-06-24 22:56:38
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tjw0824

木虫 (著名写手)

tttt
4楼2019-06-24 23:27:31
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南海所老龚

新虫 (正式写手)

单向测通也是没有问题的,前提是单向也是准确的。
TheBestandMostBeautifulThingsintheWorldCan'tBeSeenorTouched,TheyMustBeFeltwithHeart.
5楼2020-02-21 23:45:40
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