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positron

木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】Dmol3的电荷密度数据问题

计算过后得到的电荷密度数据在哪里放着呢?

计算完成后,选择分析,可以看到电荷密度在3D里的分布

这些数据可能拿出来分析,包括原子几何优化后的坐标数据?

优化晶格和优化原子坐标 的差别是啥,原子坐标都变了,晶格不也跟着优化了?


还有一个问题是,结构几何优化后的数据在哪里,结构优化后就进行结构分析时,所用的结构是否是优化后的(也就是此时结构分析是用的结构是否是update后的)?

刚刚学习,虚心请教,盼前辈能解答疑惑

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-20 at 12:49 ]
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liuxiaocunde

铁杆木虫 (著名写手)

古德里安将军

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
positron(金币+5,VIP+0):谢谢,我找找看 5-25 14:05
zxzj05(金币+2,VIP+0):3Q! ^_^ 多多支持! 5-26 11:03
找到电荷密度图的存储文件,一般是在自己所建的计算project中,隐藏的,castep模块是.charg_frm格式的,可以用txt打开后另存为txt格式。

原子几何优化后的坐标以及结构等在优化后的文件夹中有
新征途
2楼2009-05-25 12:01:44
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positron

木虫 (职业作家)

那我几何优化后,继续进行的体系性质的计算(dmol3算势能),所用的结构是优化后的么?

可要在把优化后的坐标在导入然后再计算其它性质呢?

这个问题搞不清的话,感觉算出的东西心里没底
引用回帖:
Originally posted by liuxiaocunde at 2009-5-25 12:01:
找到电荷密度图的存储文件,一般是在自己所建的计算project中,隐藏的,castep模块是.charg_frm格式的,可以用txt打开后另存为txt格式。

原子几何优化后的坐标以及结构等在优化后的文件夹中有

3楼2009-05-25 14:09:28
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北宸

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
wuli8(金币+2,VIP+0):感谢交流,(*^__^*) …… 5-25 19:56
positron(金币+2,VIP+0):感谢交流 5-26 06:54
无需再update,计算后所得到的结构就是优化后的。那个update是当你在这个结构的基础上如果进行了改动,可以再update回到优化后的那个结构。
4楼2009-05-25 15:54:38
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wenmenkui

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by liuxiaocunde at 2009-5-25 12:01:
找到电荷密度图的存储文件,一般是在自己所建的计算project中,隐藏的,castep模块是.charg_frm格式的,可以用txt打开后另存为txt格式。

原子几何优化后的坐标以及结构等在优化后的文件夹中有

怎么我用文本文档就打不开,不知道怎么回事
5楼2009-05-25 20:47:51
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positron

木虫 (职业作家)

打开后的文件是一数列数据,不是要三列数据么(三维的)?

该如何操作得到三维数据呢?
引用回帖:
Originally posted by liuxiaocunde at 2009-5-25 12:01:
找到电荷密度图的存储文件,一般是在自己所建的计算project中,隐藏的,castep模块是.charg_frm格式的,可以用txt打开后另存为txt格式。

原子几何优化后的坐标以及结构等在优化后的文件夹中有

6楼2009-05-26 07:05:08
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positron

木虫 (职业作家)

哪个文件对应的是三维的电荷密度数据呢?

一维数组是计算没完成还是其它的错误?

哪位能指点一下,谢谢
7楼2009-05-26 12:52:25
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positron

木虫 (职业作家)

盼路过的点拨一下啊
8楼2009-05-27 08:44:20
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jilly7860

铜虫 (小有名气)

我也想问这个问题啊
9楼2009-05-27 14:18:12
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positron

木虫 (职业作家)

前辈都大隐隐于市啊

悄悄的来,悄悄的去,哈哈

还是期盼热心人吧
10楼2009-05-27 16:46:32
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