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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 为什么某些基因的CDS是以TCA为起始而不是ATG
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)

[求助] 为什么某些基因的CDS是以TCA为起始而不是ATG 已有1人参与

最近在NCBI查找基因序列的时候发现有些基因不是以ATG为起始密码子的，而是以TCA为起始，以CAT为终止，为什么呢？
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1楼 2019-06-13 09:19:18
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)
那么NCBI提供的基因序列到底是模板链还是有义链，为什么我感觉一直在变
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2楼2019-06-13 10:28:48
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123DEE

铁虫 (小有名气)
反向互补

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3楼2019-06-13 12:44:01
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 123DEE at 2019-06-13 12:44:01
反向互补

我有点想不明白，可以详细解释下吗，谢谢
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4楼2019-06-13 14:09:47
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123DEE

铁虫 (小有名气)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-06-17 21:50:53
反向互补后就是ATG在前的了，反向互补后基因不变，还是那个基因

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5楼2019-06-13 17:08:41
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 123DEE at 2019-06-13 17:08:41
反向互补后就是ATG在前的了，反向互补后基因不变，还是那个基因

对，反向互补后的那条链就是以ATG开始，以TGA结束，把它翻译过来的氨基酸与该蛋白的序列一致，也就是说NCBI上显示的是该基因的非编码链，但是，，NCBI上有一些基因的序列本身就是ATG··········TGA，翻译过来也就是该蛋白，这种情况的话又显示的是编码链，为什么会有这种差别呢，如果我不知道该蛋白序列，怎么判断这条链到底是非编码链还是编码链呢
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6楼2019-06-13 20:17:45
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匿名

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★ ★ ★ ★
Cherishqj: 金币+4, ★有帮助 2019-06-17 16:08:50
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7楼2019-06-17 15:33:04
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 大-木-虫 at 2019-06-17 15:33:04
提交注释的时候是按照反向互补序列提交的，自己倒过来就行了

如果提交的基因是ATG··········TGA，就不需要反向互补，直接翻译即为蛋白序列，如果提交的基因是TCA·····CAT，就需要反向互补才能得到编码链，是这个意思吗
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8楼2019-06-17 16:12:58
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匿名

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9楼2019-06-17 16:22:48
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 大-木-虫 at 2019-06-17 16:22:48
是的，提交的序列其实很杂，需要你自己检查一下，...

我知道了，谢谢您的解答
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10楼2019-06-17 16:35:18
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