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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS中溶剂水模型的选择
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...

[交流] 【求助】MS中溶剂水模型的选择

跑动力学，加入到盒子里的水分子怎样定义其模型呢？不知道怎样在MS中设置。
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
1楼 2009-05-22 17:04:43
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yyx19840628

木虫 (著名写手)
2楼2009-05-25 07:55:47
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紊流

铜虫 (小有名气)
我也想知道。所以来留个记号。
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3楼2009-06-01 07:49:12
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sduch

银虫 (初入文坛)
★ ★ ★
TIGERYZZ(金币+2,VIP+0):谢谢交流 12-20 22:01
yyx19840628(金币+1,VIP+0):我问的不是这个啊 12-23 14:44
画一个水分子，amorphous cell->construction
设置温度，是否周期性边界，盒子里的水分子数量，密度，箱子的长和宽
这样能建立一个以水为溶剂的盒子。
赞一下(6人) 回复此楼
4楼2009-12-20 21:54:15
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
答非所问
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
5楼2009-12-23 14:33:34
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sduch

银虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+3,VIP+0):谢谢讨论 12-24 14:34
楼主的意思是Tip3p,Tip4p, SPC/E 等常用的水模型在ms里怎样设置吗
感觉ms自带的那几个力场主要针对于材料，晶体等应用，对水模型不是很擅长。也可能是ms很强大，我还没找到使用的方法。期待问题的解决
水模型专题： http://www1.lsbu.ac.uk/water/models.html
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6楼2009-12-23 22:02:38
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pumf

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢参与 12-24 14:35
引用回帖:
Originally posted by sduch at 2009-12-23 22:02:
楼主的意思是Tip3p,Tip4p, SPC/E 等常用的水模型在ms里怎样设置吗
感觉ms自带的那几个力场主要针对于材料，晶体等应用，对水模型不是很擅长。也可能是ms很强大，我还没找到使用的方法。期待问题的解决
水模型专 ...

我也觉得MS中好像没有考虑这个，或者跟你用的力场有关吧。
赞一下(11人) 回复此楼
7楼2009-12-24 14:13:17
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