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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

[交流] 【求助】退火的问题

我用的是MS中的forcite模拟退火过程。
在文献中看到如下描述。
we carried out high temperature
annealed MD simulations starting at 1000K (2 ps)
annealing to 0K (10 ps). The temperature of 1000K
is necessary to enable the molecule to overcome energy
barriers between different conformations and to
prevent the system from getting stuck in a particular
region of the conformational space.
不清楚这个1000K和0K是不是指初始温度和最后的温度?Forcite里面好像只有一个初始温度的设定?
还有那个2ps和10ps是指什么?在Forcite里面有对应的设置吗?

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 17:49 ]
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 讲到了点子上 11-20 11:07
不过实际上MD特别是第一性原理的MD降温速率都很快,一般经典MD在10的10次方那样,而第一性原理MD在10的13次方这样。
3楼2009-11-20 09:30:47
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 刚投了你一票 呵呵 11-20 11:06
当然了。
模拟退火就是让温度逐渐降低。从而找到全局最小。
当然温度要一直降啊。
真理是一点点接近的!
2楼2009-11-20 01:59:02
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

是在回答我的问题吗?怎么摸不着头脑?
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
4楼2009-11-20 15:15:35
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

Forcite里面好像只有一个初始温度的设定?
还有那个2ps和10ps是指什么?在Forcite里面有对应的设置吗?
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
5楼2009-11-20 15:15:51
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