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pumf

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】晶体建模

各位高手,我在数据库中查到了蛭石的晶体数据,但是其中的原子位置有几个元素是相同的,表示类质同象取代,但是我在输入的时候,系统提示我不让我在同一个位置上输入。以下是原子的位置。
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(B)   
Mg   1  +2    4 e   0           0.1638(11)  0.25           1.         0        0.96(16)
Mg   2  +2    4 e   0           0.4997(10)  0.25           1.         0        0.82(27)
Mg   3  +2    4 e   0           0.8332(11)  0.25           1.         0        0.86(15)
Al   1  +3    8 f   0.1042(7)   0.9997(7)   0.1545(2)      0.285      0         1.23(9)
Si   1  +4    8 f   0.1042(7)   0.9997(7)   0.1545(2)      0.715      0         1.23(9)
Al   2  +3    8 f   0.1026(7)   0.6647(15)  0.1547(1)      0.285      0         0.83(7)
Si   2  +4    8 f   0.1026(7)   0.6647(15)  0.1547(1)      0.715      0         0.83(7)

不知道在MS中如何将这些原子输入。在输入Al和Mg的时候,就提示不能输入了。

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-20 at 13:07 ]
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saitou

木虫 (正式写手)


pumf(金币+1,VIP+0):呵呵,谢谢师兄了。 5-22 09:41
可以编辑所谓原子的composition,同位的原子可以有几种不同的可能性,不知我理解的对否

另外这两天未能及时回信 不好意思啊
不抛弃,不放弃
2楼2009-05-21 23:57:41
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zzjust

新虫 (小有名气)

那要怎么输入啊?
3楼2009-05-22 10:07:58
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xing446

木虫 (小有名气)


zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢,欢迎常来 5-22 01:16
我认为Al和Si应该占有相同的位置,它们应该符合统计分布,你可以在原子的composition中将Al的比例设为0.285,Si的比例设为0.715。下面一组也一样。
我想这样就没问题了。
4楼2009-05-22 18:41:08
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leillei

木虫 (正式写手)

RE

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流! 5-23 17:11
添加原子时,在对话框 add atoms 中的options 一栏中取消选择 warn if atoms closer than 1.0A.或者可以把这个警告距离调得更小一些。
5楼2009-05-23 00:51:20
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pumf

木虫 (正式写手)

多谢各位了。
6楼2009-05-23 19:49:26
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