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无知青鸟

新虫 (小有名气)

[求助] autodock分子对接,分析出现错误 已有2人参与

对接过程按教程进行,中间无报错,对接结果出现错误。向各位老师请教,谢谢

>>> exception in _buildInputLig
ERROR *********************************************
Traceback (most recent call last):
  File "G:\GELTOOL\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto
    result = command( *args, **kw )
  File "G:\GELTOOL\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit
    d.readDlg(dlgFile)
  File "G:\GELTOOL\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg
    self.ch = ConformationHandler(self.ligMol,
AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'
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巴拉巴拉莎

新虫 (初入文坛)

您好,请问您分子对接的问题解决了吗?我用的autodock进行分子对接,进行分析的时候显示indexError:list index out of range ,请问是什么原因呀

发自小木虫Android客户端
4楼2022-06-27 11:31:06
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查看全部 4 个回答

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可能是路径问题吧,路径中不能有中文字符
2楼2019-05-24 18:11:14
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一代米哟

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

那是个崩溃的回忆。。。MGLTools老出问题的,放弃吧。用AutoDock Vina或DOCK 6真香,开源的,可以发文章,而且计算比较准确。就安装比较麻烦。不过网上有个简易教程,如果楼主土豪可以百度搜索【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(DOCK6)】,用浏览器访问的,不会出现这种软件问题。感觉对接挺到位的,速度也快几分钟,还能分析经典八大相互作用,算完直接出图出数据,方便多了。费点马内省点时间还是划算的。。。
3楼2021-12-03 11:39:22
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