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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 其他 » 【求助】关于寻找反应物和催化剂之间是否存在过渡态的问题
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stewart1922

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】关于寻找反应物和催化剂之间是否存在过渡态的问题

我做的反应，催化剂和两种反应物，现在我假设反应过程首先是催化剂和反应物之一的丙酮有氢转移的过程，如果暂时不考虑另一反应物的话，前面这个过程如何在计算中表达出来？头文件该怎么写？

请大家帮帮我...

[ Last edited by cadick on 2009-12-14 at 04:09 ]
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1楼 2009-05-21 14:24:26
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stewart1922

至尊木虫 (职业作家)
我是做小分子反应通道的，刚开始做，一种催化剂催化两种反应物，老师让我确定反应是否有过渡态，我之前在水和丙酮中优化了反应物和催化剂的构型，我想问的是，在考虑反应过程的时候，基本思路是什么？

比如说 我自己假设了一个反应的过程，包含了原子之间的进攻，氢的转移...（我刚开始做，不知道这样说是不是准确），那么怎么样在计算中表述这些过程呢？



谢谢了！！！
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3楼2009-06-01 10:22:50
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zeoliters

木虫 (正式写手)
可否详细的写出来：你想做什么，碰到的问题是什么？
上面的描述不是太清楚。
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2楼2009-05-21 17:10:55
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zeoliters

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
mingdong(金币+4,VIP+0):谢谢！ 6-4 07:19
zhaohscas1976(金币+3,VIP+0):谢谢 6-10 11:28
你首先要考虑的是选什么方法，用什么基组。还有用什么模型。
看你的描述“在水和丙酮中优化了反应物和催化剂的构型”，是不是要考虑溶剂化效应？
如果要的话，模型的选取就很重要了。
还有不知道你用的是什么软件， Gaussian？
至于反应过程，有很多种可能性。
最好考虑到所有可能的可能性（即所有可能的反应通道）
比如你所说的那样，原子之间的进攻，氢的转移等等，不同的方式，不同的位置的进攻所得到的能垒都不一样的。尽可能的找出最有利的反应通道。
一个反应通道一般可以用能量的变化来表述（即从反应物，到过渡态，在到产物的能量的变化）。
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4楼2009-06-03 20:09:02
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stewart1922

至尊木虫 (职业作家)
恩 我是用Gaussian03计算的 是要考虑溶剂化效应 所以我在优化构型的时候才把溶剂化加上去的
基组的话 我前面的工作是先用3-21G初步优化一下构型 然后再用大一点的基组比如说6-311G（d,p）惊醒优化 得到比较准确的构型
我明白版主说的意思 需要用能量来进行描述 不同的反应通道会有不同的能量曲线 但是我现在的问题是 现在我计算的体系 算上催化剂一共三个反应物 总不能是一步就到过渡态---三个分子结合到一起 脱掉一个水吧 也是要一步一步的  我的问题就是 这每一个步骤 怎么样在 计算中表达出来啊
比如说第一步 有个原子进攻的过程 不涉及到第二种反应物  那么在计算的时候就不需要 把它考虑在内了？

请指教...我的老师这段时间有事情 我没有机会问他 问题都集中在一起了 不知道怎么往下一步进行

谢谢版主了
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5楼2009-06-04 09:58:00
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