24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (2920)
>虫友互识 (231)
>导师招生 (172)
>文献求助 (171)
>论文投稿 (68)
>休闲灌水 (52)
>硕博家园 (50)
>公派出国 (48)
>考博 (40)
>招聘信息布告栏 (32)
>论文道贺祈福 (27)
>催化 (25)
>教师之家 (24)
>找工作 (24)
>考研 (22)
>博后之家 (21)

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

流浪猫小琪

银虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 411.3
帖子: 549
在线: 150.6小时
虫号: 4568499

[交流] 如何使用CBS-QB3寻找过渡态

已在其他水平下找到了过渡态，打算在此基础上使用CBS-QB3水平下通过IRCmax寻找过渡态，不知道如何写输入文件。想请教一个CBS-QB3做IRCmax的输入文件。

回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2019-05-15 11:57:24

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

这个没法一步完成。
一般来说IRCMax写法如下：
IRCMax(方法2:方法1) 含义是是在方法1的IRC途径上用方法2在每一个点都做单点能计算，找出其中能量最高的点。  但是CBS-QB3是一个多步骤的方法其中还包含了第一步一个opt步骤所以这个不能直接写的。
高斯说明书的原话也是这样说的  ： Analytic gradients are required for the IRC portion of the calculation (model1 above). Any non-compound energy method and basis set may be used for model2.  CBS-QB3就是属于 compound energy method。所以没法直接写。如果需要就只能分步骤人工计算
第一步先用方法1 算IRC ，
第二步自己提取IRC上每一个点的结构逐一用CBS-QB3做一次单点能（如果是Gaussian16 就支持CBS(NoOpt）能自动跳过其中的opt步骤，给出能量）。但是G09不支持这个写法，那么就要人工来做整个CBS步骤人为跳过opt步骤。

CBS-QB3除去优化的话需要进行四步骤
1. #p B3LYP/CBSB7 Freq
2. #p  CCSD(T)/6-31+G(d')
3. #p Geom=AllCheck Guess=Read MP4SDQ/CBSB4
4. #P Geom=AllCheck Guess=Read MP2/CBSB3 CBSExtrap=(NMin=10,MinPop)

你可以把这四部分的计算都用--link1--来隔开写在同一个文件里。

http://www.chem.ucla.edu/~mccarren/CBSQB3_worksheet/  这个网站可以帮你按照CBS-qb3的公式分别取这几个计算中有用的部分加加减减得到最后的能量。

然后对每一个点都要做一次这些运算。整个运算步骤还是挺多的。

赞一下(2人)

回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

流浪猫小琪

7楼2019-05-15 14:27:13

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 29 个回答

流浪猫小琪

银虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 411.3
帖子: 549
在线: 150.6小时
虫号: 4568499

送红花一朵

引用回帖:

7楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-05-15 14:27:13
这个没法一步完成。
一般来说IRCMax写法如下：
IRCMax(方法2:方法1) 含义是是在方法1的IRC途径上用方法2在每一个点都做单点能计算，找出其中能量最高的点。但是CBS-QB3是一个多步骤的方法其中还包含了第一步 ...

那还有没有其他的高精度的方法可以直接计算过渡态呢？我这个过渡态还是蛮多的。

赞一下

回复此楼

13楼2019-05-16 11:42:51

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

简单回复

rocisky73楼

2019-05-15 12:08 回复

流浪猫小琪(金币+2): 谢谢参与