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lingzhe

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】铜原子的力场参数哪种力场中有？

请问铜原子的力场参数哪种力场中有阿，看到uff里面是一价铜的参数。如果没有的话该怎么办呢？

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-16 at 13:42 ]
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1楼 2009-05-20 15:37:26
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dolphin100

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
xuefei06(金币+1,VIP+0):3qs 5-21 16:36
lingzhe(金币+2,VIP+0):谢谢！ 5-22 11:01
lingzhe(金币+3,VIP+0):谢谢你！ 5-24 10:28
尝试一下CVFF，我的Li Na K Be Mg Ca Al 都支持
Cu没尝试过！ 好像支持的比较多
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Constanteffortscanyieldsuresuccess!
2楼2009-05-21 12:10:57
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lingzhe

铜虫 (初入文坛)
你说的那些都是主族元素，铜是过渡金属，研究的好像不多。不知道你有没有见到过？要0价的。
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3楼2009-05-21 14:59:09
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dolphin100

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lingzhe(金币+5,VIP+0):我的问题还没有解决，先给5个金币吧，我愿意继续增加赠送金币量。 5-22 09:36
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 5-22 14:06
xuefei06(金币+1,VIP+0):3Q! 5-22 14:11
0价？ 呵呵  过渡金属没跑过， 不过一般都支持过渡金属Fe离子的
我跑的都是带电荷离子的。不过化合价好设置的，就看力场里是否支持了，
另外看看amber charmm力场吧
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Constanteffortscanyieldsuresuccess!
4楼2009-05-22 00:15:47
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lingzhe

铜虫 (初入文坛)
可以用uff里一价铜的参数通过调整改成0价铜的参数吗？参数不是不好改的吗？
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5楼2009-05-22 09:30:37
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dolphin100

木虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-25 09:58
我用DISCOVERY跑，那里选择atom，就可以设置的，里面有formal charge 和partial charge，直接写1 或者 2 就可以设置
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Constanteffortscanyieldsuresuccess!
6楼2009-05-24 20:43:26
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lingzhe

铜虫 (初入文坛)
你是用MS做的吗？用MS里面的compass力场好像可以做，但是我们老师让我尽量不用这种方法。
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7楼2009-05-25 09:03:21
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dolphin100

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
为什么不建议用呢？
我没做过MS
我用的是insightII
我估计GROMACS肯定可以支持
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Constanteffortscanyieldsuresuccess!
8楼2009-05-25 13:51:54
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lingzhe

铜虫 (初入文坛)
好的，谢谢，呵呵，我再跟老师商量一下。
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9楼2009-05-25 14:04:10
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