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lingzhe

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】铜原子的力场参数哪种力场中有?

请问铜原子的力场参数哪种力场中有阿,看到uff里面是一价铜的参数。如果没有的话该怎么办呢?

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-16 at 13:42 ]
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dolphin100

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
xuefei06(金币+1,VIP+0):3qs 5-21 16:36
lingzhe(金币+2,VIP+0):谢谢! 5-22 11:01
lingzhe(金币+3,VIP+0):谢谢你! 5-24 10:28
尝试一下CVFF,我的Li Na K Be Mg Ca Al 都支持
Cu没尝试过! 好像支持的比较多
Constanteffortscanyieldsuresuccess!
2楼2009-05-21 12:10:57
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lingzhe

铜虫 (初入文坛)

你说的那些都是主族元素,铜是过渡金属,研究的好像不多。不知道你有没有见到过?要0价的。
3楼2009-05-21 14:59:09
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dolphin100

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lingzhe(金币+5,VIP+0):我的问题还没有解决,先给5个金币吧,我愿意继续增加赠送金币量。 5-22 09:36
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 5-22 14:06
xuefei06(金币+1,VIP+0):3Q! 5-22 14:11
0价? 呵呵  过渡金属没跑过, 不过一般都支持过渡金属Fe离子的
我跑的都是带电荷离子的。不过化合价好设置的,就看力场里是否支持了,
另外看看amber charmm力场吧
Constanteffortscanyieldsuresuccess!
4楼2009-05-22 00:15:47
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lingzhe

铜虫 (初入文坛)

可以用uff里一价铜的参数通过调整改成0价铜的参数吗?参数不是不好改的吗?
5楼2009-05-22 09:30:37
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dolphin100

木虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-25 09:58
我用DISCOVERY跑,那里选择atom,就可以设置的,里面有formal charge 和partial charge,直接写1 或者 2 就可以设置
Constanteffortscanyieldsuresuccess!
6楼2009-05-24 20:43:26
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lingzhe

铜虫 (初入文坛)

你是用MS做的吗?用MS里面的compass力场好像可以做,但是我们老师让我尽量不用这种方法。
7楼2009-05-25 09:03:21
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dolphin100

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
为什么不建议用呢?
我没做过MS
我用的是insightII
我估计GROMACS肯定可以支持
Constanteffortscanyieldsuresuccess!
8楼2009-05-25 13:51:54
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lingzhe

铜虫 (初入文坛)

好的,谢谢,呵呵,我再跟老师商量一下。
9楼2009-05-25 14:04:10
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