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【讨论】opt和opt=z-matrix的区别
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以Z矩阵的形式输入的分子坐标优化的时候，opt和opt=z-matrix有什么区别？对结果有影响吗？还有就是以Z矩阵的形式输入分子的坐标时，是不是只优化Variables后面给出的变量啊？对于其他已经确定的不优化呢？ 第一个： # opt=z-matrix b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity Title Card Required 0 1 C H 1 B1 H 1 B2 2 A1 H 1 B3 3 A2 2 D1 H 1 B4 3 A3 2 D2 B1 1.07000000 B2 1.07000000 B3 1.07000000 B4 1.07000000 A1 109.47120255 A2 109.47125080 A3 109.47121829 D1 -119.99998525 D2 120.00000060 1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 5 1.0 2 3 4 5 第二个： # opt b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity 上面两种输入形式对结果有影响吗？ |
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2楼2009-05-19 15:18:55
neweroica
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lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-19 19:33
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-19 19:33
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当然有区别。但具体对于你给的这个例子，是没有区别的，因为那里的z-matrix定义的各个参数都不同。 其实你可以修改一下z-matrix，可以简化优化的过程。因为你要算的是甲烷，所以4个C-H键长以及各个键角都是相同的，所以： B1 = B2 = B3 = B4 A1 = A2 = A3 因此，可以重新定义z-matrix如下： C H 1 B H 1 B 2 A H 1 B 3 A 2 D1 H 1 B 3 A 2 D2 B 1.07000000 A 109.47120255 D1 -119.99998525 D2 120.00000060 这样，用 opt=z-matrix 就能利用对称性简化优化过程了。 |
3楼2009-05-19 18:11:07
4楼2009-05-20 08:18:21