| 查看: 1184 | 回复: 18 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
R 包 qkerntool已经更新到 1.19版本，欢迎使用
|
|||
|
说明 这是一个关于以核方法为主的r包介绍，这个包包含了许多用于分类，聚类降维和可视化的非线性机器学习工具。该包使用了条件负定核(cnd kernel)，共集成了26个核，包含q核版本和cnd版本，其中包含dbscan，谱聚类，广义判别分析 （gda），主成分分析（pca），isomap，线性判别分析（lle），sammon mapping和tsne。 1.在r中直接输入代码在cran上查找安装 install.packages("qkerntool" ) 2 直接下载好的qkerntool_1.19.tar.gz install.packages("e:/qkerntool_1.18.tar.gz" ) 3 rstudio中在菜单栏tools-install packages中查找安装 install from下拉菜单可以选择是从cran还是本地安装包安装 cnd kernel 由于用于数据分析的经典核方法通常被认为仅限于正定核，因此，在qkerntools中提出了新的距离算法，新核方法计算高维投影空间中的距离公式如下 在这里插入图片描述 qkernel使用两个向量参数之间的内核函数值，即通常依赖于由定义的内核矩阵h之类的表达式 在这里插入图片描述 更改核的参数会更改数据的投影，从而更改投影空间中的距离。 为了通过r实现负定核表达，构建了一个s4类r包，其中表示为类“qkernel”或“cndkernel”的对象。这些函数可以作为参数传递给泛型函数，这些函数可以评估更有用的内核表达式，如核矩阵 qkernmatrix 由核方法构成的核矩阵 > library("qkerntool" ) > set.seed(20181110) > x <- matrix(rnorm(300), ncol = 100) > qkfunc <- rbfbase(sigma=10,q=0.8) > qkfunc qbase qkernel function. hyperparameter : sigma = 10 q = 0.8 > qkfunc(x[1, ], x[2, ]) [,1] [1,] 4.976754 > qkernmatrix(qkfunc,x) an object of class "qkernmatrix" [,1] [,2] [,3] [1,] 0.000000 4.976754 4.969811 [2,] 4.976754 0.000000 4.960555 [3,] 4.969811 4.960555 0.000000 创造自己的核 自己输入核函数 > rbf1 <- function(x, y){ + sdist <- crossprod(x) + crossprod(y) - 2*crossprod(x,y) + sdist <- (1 - exp(log(0.8)*sdist/10))/(1-0.8) + return(sdist) >+ } > class(rbf1) <- "qkernel" > rbf1(x[1, ], x[2, ]) qkpca 参数名 内容 x n x d矩阵（n个样本，d个特征）或继承cndkernmatrix ，qkernmatrix的核矩阵 kernel 核类型 qpar 核参数 features 选择的成分个数 th 忽略主成分的特征值的值 以iris数据集为例，随机提取二十个样本为测试集，对剩余样本使用“rbfbase”核进行降维以及对应的预测，例子使用了iris数据集，代码及结果如下 data(iris) test <- sample(1:150,20) qkpc <- qkpca(~.,data=iris[-test,-5],kernel="rbfbase", qpar=list(sigma=50,q=0.8),features=2) # print the principal component vectors pcv(qkpc) #plot the data projection on the components plot(rotated(qkpc),col=as.integer(iris[-test,5]), xlab="1st principal component",ylab="2nd principal component" ) # embed remaining points emb <- predict(qkpc,iris[test,-5]) points(emb,col=as.integer(iris[test,5])) [ last edited by jjdg on 2019-4-26 at 20:55 ] [ Last edited by jjdg on 2019-4-26 at 20:55 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
工科0856专硕化学工程269能调剂吗
已经有4人回复
-
材料371求调剂
已经有3人回复
-
420求调剂
已经有3人回复
-
312求调剂
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
282分材料专业求调剂院校
已经有22人回复
-
0857 资源与环境 285分
已经有3人回复
-
标题:捡漏预警|08工科/09农学调剂!英语要求低，过线即有机会!
已经有12人回复
-
一志愿安徽大学材料工程专硕313分，求调剂的学校
已经有8人回复
-
313求调剂
已经有4人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
有机合成岗位招聘
+1/895
-
西北大学化材院张健健教授课题组招收2026“化生-探针”博士研究生1名
+2/132
-
材料/化学相关专业2026级学术/专业型硕士研究生
+1/87
-
本安ia MFC用于危险石化环境下的乙炔脱除工艺的精准取样-艾里卡特 (Alicat)
+2/82
-
86年欧洲荷比卢老留友征婚国内湖南
+1/54
-
欢迎报读澳门大学中药机制与质量研究全国重点实验室硕士研究生
+1/39
-
江苏大学环境学院课题组长期接收学硕专硕
+1/17
-
深圳大学机电与控制工程学院诚招先进制造、激光加工、增材制造、塑性成形等领域博士后
+1/12
-
内蒙古大学杰青团队张凡教授-杨阳课题组招收博士
+1/9
-
（国家级人才团队 ）医药与生物技术方向 “申请-考核”制博士研究生招生
+1/9
-
中科院深圳先进技术研究院-宁波诺丁汉大学2026年联合培养博士研究生招生
+1/6
-
长江大学武汉校区石油工程学院人才招聘-2026
+1/6
-
08调剂
+1/6
-
2026年东北石油大学“页岩油气钻采高效井眼清洁”创新团队招硕士生
+1/4
-
有青基找工作是优势还是劣势？
+1/3
-
杭州北航国新院徐梁教授招聘博士（控制/机器视觉/机器人导航操作方向）
+1/3
-
双一流天津工业大学电信学院李鸿强教授招收2026年申请审核制博士3名
+1/2
-
温州大学招收2026年入学博士研究生（化学、材料、环境）
+1/2
-
中南大学材料学院李明教授课题组诚招2026年全日制学术型博士生
+1/1
-
复旦大学集成电路学院程增光课题组急聘科研助理
+1/1
18楼2020-04-20 15:43:23
简单回复
wxw082511楼
2019-04-28 21:11
回复
xhmaohan8楼
2019-04-27 03:49
回复
2019-04-27 07:32
回复
寒山听雪(金币+1): 谢谢参与
祝福 发自小木虫Android客户端
2019-04-26 10:00
回复
liubq0812楼
2019-04-28 21:46
回复
寒山听雪(金币+1): 谢谢参与
1 发自小木虫IOS客户端
