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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 粗糙平面生成
汕头大学海洋科学接受调剂
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xueteng2

新虫 (初入文坛)

[求助] 粗糙平面生成 已有1人参与

请问大家如何用LAMMPS删除模型的一些原子来构建特定粗糙度的平面？模型信息在data文件中。刚上手LAMMPS不久，请大家指教！
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1楼 2019-04-25 21:37:13
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桃苦亦兮

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1. delete_atoms
2. 建立一个小的模型，然后沿X和Y方向重复，叫一个重复命令replicate，忘了名字了，可能这样拼的。
3. 用ovito删完输出xyz坐标，改成data就行。
4. 编程
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3楼2019-04-26 09:49:29
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luyaobao

木虫 (著名写手)
delete_atoms

发自小木虫Android客户端
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2楼2019-04-25 22:01:51
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xueteng2

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 桃苦亦兮 at 2019-04-26 09:49:29
1. delete_atoms
2. 建立一个小的模型，然后沿X和Y方向重复，叫一个重复命令replicate，忘了名字了，可能这样拼的。
3. 用ovito删完输出xyz坐标，改成data就行。
4. 编程

有学长提点我说用lammps读取data文件，用region命令划分区域，用delete atom命令删除原子，再用rewrite data命令输出新的data文件。这样可以吗？
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4楼2019-04-27 14:53:02
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