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ocina

铁杆木虫 (著名写手)

小菜虫

[求助] 关于高斯计算红外光谱 已有1人参与

请问高斯计算红外光谱是不是涉及到scale factor？，比例因子(scale factor) 是什么？
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击鼓其镗，踊跃用兵。土国城漕，我独南行。从孙子仲，平陈与宋。不我以归，忧心有忡。
1楼 2019-04-23 22:11:47
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+8 2019-04-24 07:56:34
ocina: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2019-04-25 21:13:39
计算化学中要引入频率校正因子 scale factor是为了校正在计算频率的时候用的 谐振子模型（Harmonic oscillator）所引入的误差。一般计算得到的频率的误差主要是这种忽略 anharmonicity所带来的。当然也要还有一些计算方法本身的误差。所以在一般计算完成后会乘以一个系数去校正这种误差。这些校正因子是通过大量实验拟合出来的。不同的泛函和基组对应不同的校正因子。需要查询。以下是常用的查询网站。 https://comp.chem.umn.edu/freqscale/version3b2.htm    https://cccbdb.nist.gov/vibscalejust.asp  俩网站略有区别  因为是不同的组拟合出来的。第一个链接里  Foundamental 频率校正 是和实验对照时候使用的。
用的时候如果只是校正频率 那用算出来的频率在网站上找到对应的方法和基组乘以相应系数就行。如果需要进一步校正freq计算得到的热力学量。那就需要在频率计算的时候多加一个关键词  scale=       这样算出来的热力学量就是校正过得。不过这样计算得到的频率还是原始的没校正过的 还得自己手动乘以系数才行。
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2楼2019-04-23 22:47:27
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ocina

铁杆木虫 (著名写手)

小菜虫
引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-23 22:47:27
计算化学中要引入频率校正因子 scale factor是为了校正在计算频率的时候用的 谐振子模型（Harmonic oscillator）所引入的误差。一般计算得到的频率的误差主要是这种忽略 anharmonicity所带来的。当然也要还有一些计 ...

遇见高人了，谢谢您的答复，我打开了您的链接，但是在第一个链接里找不到B3LYP/6-311**机组的？另外我想请教一下您，在写paper的时候我们计算得到的频率是unscaled frequencies, 讨论的时候必须乘以这个scale factor, 然后讨论吗？不考虑可不可以。问题有点多，非常感谢您！
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击鼓其镗，踊跃用兵。土国城漕，我独南行。从孙子仲，平陈与宋。不我以归，忧心有忡。
3楼2019-04-24 15:59:00
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by ocina at 2019-04-24 02:59:00
遇见高人了，谢谢您的答复，我打开了您的链接，但是在第一个链接里找不到B3LYP/6-311**机组的？另外我想请教一下您，在写paper的时候我们计算得到的频率是unscaled frequencies, 讨论的时候必须乘以这个scale fact ...

嗯 链接里是不全的 毕竟那个组没有把所有可能的方法都拟合出来。用第二个链接里的因子就可以。我觉得如果和实验做比较，并且明显是矫正之后更贴近实验值了 那就应该用校正因子矫正之后的值。
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4楼2019-04-24 20:48:31
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ocina

铁杆木虫 (著名写手)

小菜虫
引用回帖:
4楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-24 20:48:31
嗯 链接里是不全的 毕竟那个组没有把所有可能的方法都拟合出来。用第二个链接里的因子就可以。我觉得如果和实验做比较，并且明显是矫正之后更贴近实验值了 那就应该用校正因子矫正之后的值。...

谢谢您，paper里引用第二个链接里的值应该要文献支持吧，您知道这个值出自哪篇文献不？再次感谢您！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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击鼓其镗，踊跃用兵。土国城漕，我独南行。从孙子仲，平陈与宋。不我以归，忧心有忡。
5楼2019-04-25 11:00:11
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paramecium86

版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by ocina at 2019-04-24 22:00:11
谢谢您，paper里引用第二个链接里的值应该要文献支持吧，您知道这个值出自哪篇文献不？再次感谢您！
...

直接引用CCCBDB 这个库就行  网址里是引用这个库的方法。https://cccbdb.nist.gov/creditsx.asp
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6楼2019-04-25 11:38:20
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ocina

铁杆木虫 (著名写手)

小菜虫
引用回帖:
6楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-25 11:38:20
直接引用CCCBDB 这个库就行  网址里是引用这个库的方法。https://cccbdb.nist.gov/creditsx.asp...

我发现我计算出来的频率和实验的红外频率比较接近，但是乘以scale factor 之后反而偏离了很多，是不是在paper里面讨论时说明这种偏离的情况，然后不用这个scale factor就可以？谢谢您的答复。
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击鼓其镗，踊跃用兵。土国城漕，我独南行。从孙子仲，平陈与宋。不我以归，忧心有忡。
7楼2019-04-25 13:51:51
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乔西西

新虫 (著名写手)
跟你说，如果计算的数据是要跟实验数据对比的话，一定要乘以系数的，因为这才是最准确的

发自小木虫Android客户端
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8楼2019-09-27 02:18:49
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