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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 如何在真空盒子中放入单个分子
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polyson

铜虫 (小有名气)
已领完
如何在真空盒子中放入单个分子
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虫友们，想请教一个问题：本人按照文献上的方法，将构建好的超晶胞删去所有晶态分子，接下来应是放入单个DL-苹果酸分子在这个真空盒子中，请问这一步怎么操作呢？用amorphous cell calculation中的pack得到的是无序的大量分子。

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1楼 2019-04-23 14:55:40
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kgd_ons

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也想知道，楼主解决了吗

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4楼2019-04-23 15:01:42
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polyson

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by kgd_ons at 2019-04-23 15:01:42
我也想知道，楼主解决了吗

我现在暂时的解决方案是构建原始晶胞的超晶胞，然后删掉多余分子，只留一个分子在超晶胞内。

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14楼2019-04-23 15:26:15
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tzynew6楼
2019-04-23 15:04   回复  
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hdchina20102楼
2019-04-23 14:56   回复  
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ZloveA8楼
2019-04-23 15:13   回复  
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187722771325楼
2019-04-23 15:01   回复  
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乖咩咩12楼
2019-04-23 15:24   回复  
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知识无间11楼
2019-04-23 15:19   回复  
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zfpd27667楼
2019-04-23 15:11   回复  
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暖我心安9楼
2019-04-23 15:14   回复  
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2019小猪猪13楼
2019-04-23 15:25   回复  
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kgd_ons3楼
2019-04-23 15:01   回复  
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96021310楼
2019-04-23 15:15   回复  
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