| 查看: 1428 | 回复: 0 | ||
一棵安静的树金虫 (小有名气)
|
[求助]
BLAST中关于字长WORD SIZE的设定问题!
|
|
生物信息学中,BLAST章节里,关于字长的设定里,是这么描述的:WORD SIZE:所谓字长是指用作比对起始种子的序列长度。将查询序列分割成一系列特定长度的小的序列段(字段)或(搜索窗口)。 默认值:核酸为11,氨基酸为3。 蛋白质:字段增大,搜索精度提高; 核酸:字段降低,搜索更准确,速度更慢。 为什么蛋白质是字段增大,精度增加,而核酸是字段降低,精度增加。问了几个人,大家对于这里的理解都不一样。所以发帖请教。 请虫友们不吝赐教! |
» 猜你喜欢
为什么蛋白质氨基酸测定大家都测17种?
已经有5人回复
《灰分记:我与坩埚的“灰烬”之恋》
已经有3人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有290人回复
求助 食品检验工(基础知识),中国劳动社会出版社 电子版
已经有5人回复
胶体几丁质的结晶度?
已经有0人回复
诚挚招收全日制博士!!!中国农业科学院麻类研究所谭志坚研究员课题组招收博士
已经有2人回复
三甲基羟乙基丙二胺的合成路线
已经有5人回复













回复此楼