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chemzhh

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】请问计算稳态结构时出现虚频是什么原因

我用gaussian优化了MePhPhMe(就是两个甲苯对位联起来的结构)的结构后,计算正常结束(normal termination),然后计算其红外频率,发现有一个虚频-51.07,强度为0.0061,这是为什么,频率计算也是正常结束,没有报错。谢谢了。
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neweroica

木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-20 10:07
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Originally posted by snoopyzhao at 2009-5-18 11:54:
优化很多时候与初始结构有关。

另外,优化大部分不能获得全局最优,只是局部最优,而这个局部最优也可以满足收敛条件,也可以得到 4 个 yes 的。

非也。 4 个 yes表明是势能面上的驻点,而不一定是极小值点。
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7楼2009-05-19 22:35:07
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neweroica

木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-20 10:08
引用回帖:
Originally posted by suntao1982 at 2009-5-18 07:59:
还有一个办法,就是找到有虚频的那一列,把原子坐标加上去,再从新计算!

正解。不过gaussview4已经带有这个功能了,可以自动导出坐标,不再需要我们手工去做了。
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8楼2009-05-19 22:35:30
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neweroica

木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-20 10:08
引用回帖:
Originally posted by chemzhh at 2009-5-17 22:58:
我用gaussian优化了MePhPhMe(就是两个甲苯对位联起来的结构)的结构后,计算正常结束(normal termination),然后计算其红外频率,发现有一个虚频-51.07,强度为0.0061,这是为什么,频率计算也是正常结束,没有报错 ...

怀疑你是不是把两个苯环放在同一个平面内了。因为,按照有机化学常识,联苯是有很大的扭转角,因为氢原子间的Pauli排斥。
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9楼2009-05-19 22:37:43
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neweroica

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-20 10:08
引用回帖:
Originally posted by chemzhh at 2009-5-19 20:54:
能否说频率计算无虚频,那么对应的结构就是全局最优呢?谢谢

当然不是。无虚频只是保证在当前的计算方法下,得到的结构对应势能面上的极小值点(即势能面的各个方向上都是最小值)。但完整的势能面可能有很多极小值点(称为局部极小点),当然还可能有鞍点(在某些个方向上是最小值,但在其他方向上则是极大值。如果是一级鞍点,那就是过渡态)。

在完整的势能面上的所有可能的极小值中,能量最低的那个极小值点就是全局极小值点,对应该分子的热力学最稳定的结构(当然有时还应该考虑零点能)。要找全局极小值点,是个非常非常非常复杂的事情,需要对整个势能面进行全面的扫描。
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10楼2009-05-19 22:43:42
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neweroica

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lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 5-20 10:08
引用回帖:
Originally posted by chemzhh at 2009-5-19 23:33:
谢谢楼上的详尽解释。
既然通常优化的结构只是一个极小值,或者仅仅只是势能面上的一个驻点,那么根据这个结构计算出的能量有意义吗?还是每个结构必须找到全局最优,然后计算出的能量才行,尽管找到全局最优很难

也许我前面解释得可能有些误导,补充一下:

1. 并非只有全局极小值点才最重要。就好比不同的同分异构体,固然最稳定的那个同分异构体更容易得到,但其他相对能量稍高的异构体同样也可能存在,甚至更有特殊的意义。稳定性还得看不同极小点之间的能垒(决定异构化转换的难易,即动力学稳定性)。如果虽然局部极小点的能量较高,但由它转变成邻近极小点的能垒很高,那么它依然可能稳定存在(即亚稳)。

2. 通常优化的结构仅仅只是势能面上的一个驻点。所以,得进行振动频率的计算来看看有没有虚频率,如果没有,才能真正令人信服地确定是真正的极小值点(但这也取决于计算采用的方法,我就遇到过某个结构在MP2方法下是极小指点,而在B3LYP方法下却存在虚频,相反的情况也遇到过。)

3. 但实际上在很多情况下我们往往并不需要进行频率计算,因为频率计算的代价较大。比如,让你优化苯分子,结果肯定是极小值点,没必要进行频率分析。为什么?因为,我们没有必要说明都依赖于计算化学——因为我们还有化学的基本常识。所以,准备计算之前,以及得到计算结果之后,都要充分运用自己的化学基础知识,不能为计算而计算,不能把程序当成黑盒子。有时候,即使你运用常识,也还是拿不定某个结构究竟是不是极小值点,到底有没有虚频率(特别对于柔性分子,往往会存在一些比较小的虚频率)。我们可以用比较廉价的方法进行优化和频率计算。比如,用MP2进行频率计算所需要的代价要比相同基组下用B3LYP进行频率计算所需要的代价大得很多。这时,你就可以用B3LYP进行频率计算,来确认一下是否是极小值点(当然,这仍然不能保证其在MP2下就一定也是极小值点,但有总比没有好:Algo es algo.)
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12楼2009-05-20 02:11:09
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