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hhudixue

新虫 (小有名气)

[交流] 求助:是否做了基因功能预测,就不需要测相对应的功能酶,也不用测qPCR? 已有2人参与

比如,我可以通过对基因组进行KEGG分析,得到我所要研究的功能基因的多少,以此来判定微生物某种功能的活性。但是,我也可以通过测定样品中对应的微生物酶活性来衡量微生物某种功能的活性。此外,我还可以直接用qPCR测定样品中的功能基因的克隆数来衡量某种功能的活性。
      那么问题来了,当我要讨论微生物某一功能的活性时,我是不是只需要做到上述3种分析/实验当中的1种,就可以了??还是说,最好是把这3种分析/实验都做了才更能说明问题?我想知道,到底要怎么去选择。或者谁能告诉我这其中的关系,如何看待他们。谢谢回答。
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y214575

金虫 (小有名气)

生物工程师


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kegg分析之后最好在做一下酶活性表征,一个作为原因或假设,一个作为结果验证

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2楼2019-04-15 21:37:34
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hhudixue

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by y214575 at 2019-04-15 21:37:34
kegg分析之后最好在做一下酶活性表征,一个作为原因或假设,一个作为结果验证

噢噢。谢谢,确实多手段考虑是最好的。我也觉的,KEGG建立在预测的基础上可能确实不如实测来的有用。
3楼2019-04-15 22:39:29
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408795063

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
功能基因预测其实准确度比较差,有时候结果很离谱,也就是凑凑数据而已,肯定还是实测的准啊!

发自小木虫IOS客户端
4楼2019-12-12 00:02:13
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408795063

新虫 (小有名气)

其他二者都比功能基因预测靠谱

发自小木虫IOS客户端
5楼2019-12-12 00:03:13
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