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k彬彬

新虫 (初入文坛)

[交流] 求个测序大佬来救救孩子吧 已有5人参与

基因测序应该是做生物分子所必备的实验技能,小白第一次做也没人带,提取了叶片dna pcr完送去测序后,返回来的ABI文件怎么分析序列不同呢?chormas会用一点,怎么比较两个碱基序列是否一样呢?我是笨办法复制序列到word里一个一个碱基比较……一会就看晕了 而且也不知道比较哪里到哪里的碱基(目标区间200bp左右)
目的1 检测样本是否为突变体
目的2 检测样本是否为纯和突变

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k彬彬

新虫 (初入文坛)

主要是想问问大佬们用什么软件比较,我去找教程看看

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2楼2019-04-15 14:13:34
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965688871

银虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我用的seqman,你可以看看教程
3楼2019-04-15 14:44:47
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k彬彬

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 965688871 at 2019-04-15 14:44:47
我用的seqman,你可以看看教程

好的感谢 我去找找看

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4楼2019-04-15 14:50:47
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lizimu566

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
NCBI就可以比对序列
5楼2019-04-15 16:43:59
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k彬彬

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lizimu566 at 2019-04-15 16:43:59
NCBI就可以比对序列

长姿势了 去看看

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6楼2019-04-15 18:34:52
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小松鼠45

捐助贵宾 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-04-15 22:18:54
Vectot NTI, DNAMAN,Snapgene,都有序列比对的功能,简单又方便

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7楼2019-04-15 18:54:45
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Esther_Young

铜虫 (小有名气)

8楼2019-04-16 10:40:13
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yipobing

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ucsc blat 功能很好用知道物种的话
9楼2019-04-16 11:13:06
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k彬彬

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 小松鼠45 at 2019-04-15 18:54:45
Vectot NTI, DNAMAN,Snapgene,都有序列比对的功能,简单又方便

可以帮助解链分析吗

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10楼2019-04-16 12:51:02
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