| 查看: 3471 | 回复: 10 | ||
[求助]
MD分子动力学NVT计算任务老是失败,求助大神帮帮忙
|
|
在做了10000ps的几何优化后，模拟NVT，总是出现这个错误，求大神帮帮忙，谢谢啦！ Forcite ------- Task : Dynamics Version : 8.0 Build date : Dec 5 2014 Host : localhost.localdomain Threads : Parallel 39 Operating system : linux Task started : Wed Apr 10 11:23:16 2019 ---- Dynamics parameters ---- Ensemble : NVT Temperature : 343.00 K Control method : Nose Q ratio : 0.0100000 Timestep : 1.00 fs Number of steps : 1200000 Duration : 1200 ps Initial velocities : Random Random number seed : 1554866597 ---- Energy parameters ---- Forcefield : COMPASSII (Version 1.2) Charges : Forcefield assigned Electrostatic terms: Summation method : Ewald Accuracy : 0.001 kcal/mol Buffer width : 0.5 A van der Waals terms: Summation method : Atom based Truncation method : Cubic spline Cutoff distance : 12.5 A Spline width : 1 A Buffer width : 0.5 A ---- Thermostat ---- Nose mass parameter, Q mass: 121.974 kcal/mol*ps^2 ---- Constraints ---- Position constraints : 5855 Dynamics calculation - Deviation in total energy (265293 kcal/mol) between successive steps was greater than the specified maximum (50000 kcal/mol). Try relaxing the structure with geometry optimization, reducing the time step, reducing the temperature or a combination of these. Task terminated : Wed Apr 10 11:24:03 2019 Total CPU time used by Forcite: 20 seconds (20.23s) Termination status : Error |
回复此楼» 猜你喜欢
科研孤儿太难了
已经有19人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有9人回复
-
明天应该可查了！？
已经有4人回复
-
什么时候开奖？
已经有11人回复
-
范进中举一文的中心思想
已经有6人回复
-
建议基金发布提前给出明确的时间点
已经有14人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有17人回复
-
让我中一个面上吧！
已经有15人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有5人回复
-
跳槽后在研项目怎么办？
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
windy0859
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1184.2
- 散金: 700
- 红花: 4
- 帖子: 891
- 在线: 303.9小时
- 虫号: 6182637
- 注册: 2017-03-29
- 性别: GG
- 专业: 星系和类星体
2楼2019-04-10 12:06:27
3楼2019-04-10 15:12:26
windy0859
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1184.2
- 散金: 700
- 红花: 4
- 帖子: 891
- 在线: 303.9小时
- 虫号: 6182637
- 注册: 2017-03-29
- 性别: GG
- 专业: 星系和类星体
4楼2019-04-10 15:24:02
windy0859
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1184.2
- 散金: 700
- 红花: 4
- 帖子: 891
- 在线: 303.9小时
- 虫号: 6182637
- 注册: 2017-03-29
- 性别: GG
- 专业: 星系和类星体
5楼2019-04-10 15:31:55
6楼2019-04-10 22:34:52
7楼2019-04-11 08:55:35
S-Loser
新虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1126.4
- 散金: 218
- 红花: 3
- 沙发: 1
- 帖子: 613
- 在线: 232.2小时
- 虫号: 7545220
- 注册: 2017-11-29
- 专业: 特种医学(航空、航天、航海
8楼2019-04-11 16:56:47
9楼2019-04-12 15:30:58
10楼2020-04-03 17:41:51
40