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qizhuixia

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助大佬!!!关于CI计算如何输入H2O的基组 已有1人参与

情况是这样的,我想计算两个水分子(通过氢键相连)这个系统的衰败宽度,想用cc-pvdz这个基组,这样输入是否正确(只是data部分):

$DATA
water ccpvdz
CN 1

O 8.0 0.61613258971905416 1.2945922650017754 0.43576112323695337
S   8
  1  11720.0000000              0.0007100
  2   1759.0000000              0.0054700
  3    400.8000000              0.0278370
  4    113.7000000              0.1048000
  5     37.0300000              0.2830620
  6     13.2700000              0.4487190
  7      5.0250000              0.2709520
  8      1.0130000              0.0154580
S   8
  1  11720.0000000             -0.0001600
  2   1759.0000000             -0.0012630
  3    400.8000000             -0.0062670
  4    113.7000000             -0.0257160
  5     37.0300000             -0.0709240
  6     13.2700000             -0.1654110
  7      5.0250000             -0.1169550
  8      1.0130000              0.5573680
S   1
  1      0.3023000              1.0000000
P   3
  1     17.7000000              0.0430180
  2      3.8540000              0.2289130
  3      1.0460000              0.5087280
P   1
  1      0.2753000              1.0000000
D   1
  1      1.1850000              1.0000000

H 1.0 1.20979641732937180 1.1399408154279724 1.2384371269171006
S   3
  1     13.0100000              0.0196850
  2      1.9620000              0.1379770
  3      0.4446000              0.4781480
S   1
  1      0.1220000              1.0000000
P   1
  1      0.7270000              1.0000000

H 1.0 0.14980528497444778 0.39660064520917754 0.20962755813354148
S   3
  1     13.0100000              0.0196850
  2      1.9620000              0.1379770
  3      0.4446000              0.4781480
S   1
  1      0.1220000              1.0000000
P   1
  1      0.7270000              1.0000000

O 8.0 -0.57771364708940753 -1.2209515091573029 -0.42399613287644144
S   8
  1  11720.0000000              0.0007100
  2   1759.0000000              0.0054700
  3    400.8000000              0.0278370
  4    113.7000000              0.1048000
  5     37.0300000              0.2830620
  6     13.2700000              0.4487190
  7      5.0250000              0.2709520
  8      1.0130000              0.0154580
S   8
  1  11720.0000000             -0.0001600
  2   1759.0000000             -0.0012630
  3    400.8000000             -0.0062670
  4    113.7000000             -0.0257160
  5     37.0300000             -0.0709240
  6     13.2700000             -0.1654110
  7      5.0250000             -0.1169550
  8      1.0130000              0.5573680
S   1
  1      0.3023000              1.0000000
P   3
  1     17.7000000              0.0430180
  2      3.8540000              0.2289130
  3      1.0460000              0.5087280
P   1
  1      0.2753000              1.0000000
D   1
  1      1.1850000              1.0000000

H 1.0 -1.5746335435163650 -1.2212884001307356 -0.39367330877139639
S   3
  1     13.0100000              0.0196850
  2      1.9620000              0.1379770
  3      0.4446000              0.4781480
S   1
  1      0.1220000              1.0000000
P   1
  1      0.7270000              1.0000000

H 1.0 -0.39966995256225191 -1.4935067198219192 -1.2426390564127234
S   3
  1     13.0100000              0.0196850
  2      1.9620000              0.1379770
  3      0.4446000              0.4781480
S   1
  1      0.1220000              1.0000000
P   1
  1      0.7270000              1.0000000

$END

如果想用cc-pvdz基组加上1s1p1d基组让计算更精确,我是应该只在两个氧分子加,还是在6个分子上都加上?
求助!!
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qizhuixia

新虫 (初入文坛)

研究的是原子间库伦decay,其中一个水分子的氧原子处于激发态,退激后把相邻水分子中的氧原子激发,计算这个氧原子的衰败宽度
2楼2019-04-08 17:22:15
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2019-04-09 09:03:22
qizhuixia: 金币+40, ★★★★★最佳答案 2019-04-09 16:14:12
这样写是可以的。如果直接加一些基函数进去 也就是相当于给基组加弥散。这个确实算氢键这种弱相互作用是必要的。  要加就给所有原子都加。  不过与其这样不如直接用 aug-cc-pvdz 基组  也就是 对H 加一个 s 一个p 对而O加 一个s 一个p 一个d。
3楼2019-04-08 22:28:22
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qizhuixia

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-08 22:28:22
这样写是可以的。如果直接加一些基函数进去 也就是相当于给基组加弥散。这个确实算氢键这种弱相互作用是必要的。  要加就给所有原子都加。  不过与其这样不如直接用 aug-cc-pvdz 基组  也就是 对H 加一个 s 一个p 对 ...

如果都加的话到7s7p7d,计算就慢的不行。。。如果只给氧原子加合理么?
4楼2019-04-08 23:14:24
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qizhuixia

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-08 22:28:22
这样写是可以的。如果直接加一些基函数进去 也就是相当于给基组加弥散。这个确实算氢键这种弱相互作用是必要的。  要加就给所有原子都加。  不过与其这样不如直接用 aug-cc-pvdz 基组  也就是 对H 加一个 s 一个p 对 ...

还有一个问题,如果想要结果更准确,用cc-pvtz基组,可不可以只给氧原子换成tz,其他氢原子还是dz,这样行么……
5楼2019-04-08 23:54:14
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paramecium86

版主 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
zhou2009: 金币+5 2019-04-09 09:03:53
引用回帖:
4楼: Originally posted by qizhuixia at 2019-04-08 10:14:24
如果都加的话到7s7p7d,计算就慢的不行。。。如果只给氧原子加合理么?...

倒是也不是不行 类似于 jul-cc-pVnZ 系列基组,  就是不对H加弥散 但是保持对其它原子加弥散的一系列基组。 这样做说得通。不过 我不确定 单纯加弥散加到7s 7p 7d 是不是合理   这也太不好收敛了。而且 单纯的加spd 而不升高基组最高的角动量是不是对结果有很大帮助就不好说了。 差不多大小的基组里,这算出来 感觉结果不一定有
aug-cc-pVQZ 这种含有高角动量的基组的结果好。
6楼2019-04-08 23:55:00
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paramecium86

版主 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
zhou2009: 金币+5 2019-04-09 09:04:23
引用回帖:
5楼: Originally posted by qizhuixia at 2019-04-08 10:54:14
还有一个问题,如果想要结果更准确,用cc-pvtz基组,可不可以只给氧原子换成tz,其他氢原子还是dz,这样行么……...

分子不大的话 真的很难说服别人 (比如以后发文章的审稿人 )这样做的原因。。。。而且这分子里 H也并不是无关紧要的部分。并且前提是之前已经用了超大的弥散的dz基组算的。  哪怕是把弥散函数减下来 O H 都用 ang-cc-pvtz 也感觉上比 俩氧原子把弥散加到7s 7p 7d,7f的tz基组 而一边6个H用小小的dz基组更加合理。
7楼2019-04-09 00:05:22
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qizhuixia

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-09 00:05:22
分子不大的话 真的很难说服别人 (比如以后发文章的审稿人 )这样做的原因。。。。而且这分子里 H也并不是无关紧要的部分。并且前提是之前已经用了超大的弥散的dz基组算的。  哪怕是把弥散函数减下来 O H 都用 ang-c ...

谢谢老哥,我再想想
8楼2019-04-09 16:13:56
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