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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 发酵/表达 » 酶基因克隆的问题
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0508340213

新虫 (小有名气)

[求助] 酶基因克隆的问题

筛选到一株产酶菌株，经鉴定未找到genebank上有关该菌株此酶基因序列，已查到的一些其他菌种产生该酶的基因信息，设计引物时引物的模板该如何选择呢，还有如果我用已经公开的其他菌种的酶基因设计引物，并且能够扩增我的样品，是不是扩增得到的序列不能确定就是全序列呢，这种情况下应该怎么获得该酶的基因信息呢，还望高手指导

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1楼 2019-04-03 15:44:12
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Holly299

新虫 (小有名气)
在数据库中找同属同种的菌株这个基因的序列，设计引物即可。

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2楼2019-04-03 15:53:58
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0508340213

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Holly299 at 2019-04-03 15:53:58
在数据库中找同属同种的菌株这个基因的序列，设计引物即可。

找不到的情况下该如何设计呢，只能够找到同属

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3楼2019-04-03 16:02:34
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Holly299

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 0508340213 at 2019-04-03 16:02:34
找不到的情况下该如何设计呢，只能够找到同属
...

那就同一个属不同种的多找一些，放在一起做序列比对，先保守的区域设计引物

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4楼2019-04-03 17:53:23
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0508340213

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Holly299 at 2019-04-03 17:53:23
那就同一个属不同种的多找一些，放在一起做序列比对，先保守的区域设计引物
...

老师，您好，我请教一下您，根据基因名称搜索到的蛋白质序列如何找到对应的基因序列及序列号呢，我点击DBSOURCE accession链接到的是complete genome，请问我怎么截取我要的序列呢，怎么找到这个蛋白对应的基因序列号呢?谢谢！

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5楼2019-05-09 16:40:15
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