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放逐孤岛

铜虫 (小有名气)

[求助] Non-numeric pressure - simulation unstable

我在使用lammps读入我刚刚写好的restart文件时,产生了这个错误:
ERROR: Non-numeric pressure - simulation unstable (../fix_nh.cpp:1038)
这会是什么原因呢,请大家帮我看一下
我的in文件:
read_restart            restart1.file

neighbor                2 bin
neigh_modify         delay 0 every 10 check yes

dump                     1 all atom 1000 dump.lammpstrj

thermo_style          custom step temp pe etotal press vol
thermo                   100

fix                           1 all npt temp 116.82 116.82 $(100.0*dt) iso 20 -400 1.0
timestep                 1
run                         1

fix                          1 all npt temp 116.82 116.82 $(100.0*dt) iso -400 -400 25.0
timestep                1
run                         100000

write_restart           "restart2.file"

链接: https://pan.baidu.com/s/1dyORn5KOWUOj2t5vugwI8g 提取码: ayxu
这个是源文件的地址
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搬砖的狗子

新虫 (初入文坛)

5楼2021-11-21 21:24:40
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放逐孤岛

铜虫 (小有名气)

我找到了一部分原因,是我的数值发散导致了这个错误。我修改了参数后可以计算了,然后计算了部分数据,结果如下:
Per MPI rank memory allocation (min/avg/max) = 30.81 | 30.82 | 30.82 Mbytes
Step Temp PotEng TotEng Press Volume
   10001    116.05116   -451282.31   -278367.17   -71.398375     34852070
   10100    111.01823    -437462.8   -272046.68   -198.26378     36272261
   10200    108.08415   -426547.22   -265502.85   -198.13712     37045806
   10300    106.94912   -417128.38   -257775.19   -198.04581     37836073
   10400    106.46244   -407738.39   -249110.34   -197.62584     38697213
   10500    106.12565   -397667.18   -239540.94   -197.21792     39677059
   10600    106.07937    -387294.9   -229237.62   -196.68675     40766912
   10700     105.9978   -376011.89   -218076.15   -195.98214     42027638
   10800    105.86741   -363704.99   -205963.54    -194.9769     43503980
   10900    105.65782   -350145.11   -192715.94   -193.50238     45264696
   11000    105.04697   -334378.57   -177859.56    -191.1722     47464853
   11100     104.1841   -316208.34      -160975   -187.49958     50255070
   11200    103.04179   -294870.36   -141339.05   -181.61763     53928105
   11300    101.50664   -269045.43   -117801.47   -171.34534     59018740
   11400    99.424484   -236820.83   -88679.272   -153.10299     66568759
   11500    96.194298   -194718.13   -51389.526   -121.85042     79065126
   11600    88.997703    -133705.7   -1099.9542   -70.232476 1.0565983e+08
   11700    62.876195   -38285.259    55399.686   -2.5910112 2.2204799e+08
ERROR: Non-numeric pressure - simulation unstable (../fix_nh.cpp:1038)
Last command: run                     100000

明显数据发散的很严重,所以我猜测是数据发散引起的原因。
但是我现在的问题是出现这个问题后我该如何处理呢,请各位提供一些建议。
2楼2019-03-28 16:43:12
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独往烟火

铁虫 (初入文坛)

您好,请问您解决这个问题了吗?您修改了哪些参数呢?
3楼2019-11-05 20:18:24
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TDTR

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 放逐孤岛 at 2019-03-28 16:43:12
我找到了一部分原因,是我的数值发散导致了这个错误。我修改了参数后可以计算了,然后计算了部分数据,结果如下:
Per MPI rank memory allocation (min/avg/max) = 30.81 | 30.82 | 30.82 Mbytes
Step Temp PotE ...

您好,请问您是如何处理的?您修改了哪些参数呢
4楼2021-07-26 18:34:54
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