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dytloveyou

新虫 (初入文坛)

[交流] 请问大神们如何鉴定混合菌群中的各个菌种 已有7人参与

我今年刚研一,老师新申请了一个课题给我们几个新生去做。我做的是普洱茶渥堆发酵中微生物群落结构动态变化。由于知识能力有限,我想请问一下虫友们,比如说我现在将普洱茶样品稀释后涂布在平板上,长出那么多菌落,我该如何去鉴定它们呢,并对其进行计数?老师让我们提总DNA分别对16s和18srDNA扩增后测序,但是我还是只能知道这个样品中有哪些菌,我不认识他们没法计数。可能我问的问题有点低级喔,刚刚开始做这个课题实在是不懂。麻烦各位啦知道的和我说一下。

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quiller2000

木虫 (著名写手)

致良知
2楼2019-03-24 20:39:21
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snmrna

铁杆木虫 (著名写手)

★
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16S rRNA高通量测序就完了

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3楼2019-03-24 22:39:56
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

★
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根据菌落形态挑单克隆,大概就好,没法那么准确的。然后提DNA,分别用16S和18S做PCR扩增,分别针对细菌和真菌,然后把PCR产物给测序公司。

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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
4楼2019-03-25 08:12:25
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

★
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生化鉴定是金标准,不过你可以先试试16s
5楼2019-03-25 09:04:29
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6楼2019-03-26 14:43:34
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瞎子瞎了

新虫 (小有名气)

★
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16S、18S、ITS等扩增子测序   也就是我们常说的高通量测序 分析微生物多样性  一般都是交给公司做的
7楼2019-03-26 15:21:20
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好运连连OK

新虫 (小有名气)

★
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计数你可以把样品粉碎(或不粉碎),取单位重量用生理盐水稀释后涂板计数,具体可以在食品伙伴网下载菌落总数计数的国家标准参考,有详细流程和试剂配置以及数据可信区间,多做几个重复,结果可以根据菌落形态做大致判断,需要准确的数据也可以全部测序看结果,反正现在测序很便宜

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8楼2019-03-27 11:16:47
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