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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 环境 » 交流探讨 » 【原创】DGGE回收条带的测序问题
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mahayana

铜虫 (小有名气)

[交流] 【原创】DGGE回收条带的测序问题

回收条带的测序结果要通过Sequin向Genbank提交，其中要将序列写成FASTA格式，特别是第一行，实在不会写，不知哪位高手有做过，能不能给具体讲讲，最好给个环境样品的例子，不胜感激！
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1楼 2009-05-12 19:54:25
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mahayana

铜虫 (小有名气)
我在ncbi上找到这样一条
>gi|73917608|gb|DQ105639.1| Uncultured bacterium isolate DGGE gel band 3 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
CCCGTCCCGCCGCCCCCGCCCGCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATATTGGGCAATGGAGGCAACTCTG
ACCCAGCCACGCCGCGTGGAGGATGAAGGTGCTATGCATTGTAAACTTCTTTTGTCAAGGGAGAAAGTGC
TTGATTAATCAGGAAAGACGGTACTTGGCGAATAAGCATCGGCTAACTACCGG

其中>gi|73917608|gb|DQ105639.1|各代表什么意思？
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2楼2009-05-12 20:51:14
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doreen_qd

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
在提交的时候是不用带上这样的编号的
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3楼2010-03-24 15:23:43
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