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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】【求助】在MS中如何构建Si(100)-2×1表面
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lcl211

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】在MS中如何构建Si(100)-2×1表面

我想了解Si(100)-2×1表面的吸附问题，选用的是Si9H12-(OH)2团簇；

1）切面cleave plane（100）;top 0.25;depth 1.0，切面后的结构和文献上类似，但是文献中顶层的两个Si原子之间有键，我切出来的结构没有。
2）加氢时，要把原来的硅键都删除掉才行，不知有没有更简便的方法

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-20 at 13:26 ]
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1楼 2009-05-12 14:49:36
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ilyx8050

禁虫 (正式写手)
★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流！ 5-17 17:23
本帖内容被屏蔽
2楼2009-05-13 18:23:15
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archhector

★ ★
qasd(金币+2,VIP+0):谢谢~ 5-13 20:05
引用回帖:
Originally posted by lcl211 at 2009-5-12 14:49:
我想了解Si(100)-2×1表面的吸附问题，选用的是Si9H12-(OH)2团簇；

1）切面cleave plane（100）;top 0.25;depth 1.0，切面后的结构和文献上类似，但是文献中顶层的两个Si原子之间有键，我切出来的结构没有。
...

1.首先你要明白，这个显示结构里面的键其实只是相互作用的直观化，键是为了便于加强对原子相互作用的理解。没有画出来键并不代表它们不存在相互作用。只要位置是对的就没有关系，或者你用CPK模式，这样就只关注空间位置了。
2.替换时一般先建晶胞，再在定义超原胞以去除某些对称性。然后可以试试直接选中你想替换的原子，更改元素类型。不过还是有不止一个原子被替换的可能性，如果它们是等效或对称的。
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3楼2009-05-13 18:50:15
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
引用回帖:
Originally posted by archhector at 2009-5-13 18:50:

1.首先你要明白，这个显示结构里面的键其实只是相互作用的直观化，键是为了便于加强对原子相互作用的理解。没有画出来键并不代表它们不存在相互作用。只要位置是对的就没有关系，或者你用CPK模式，这样就只关注 ...

很对
新虫水平高
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快乐科研，快乐生活。
4楼2009-05-13 19:35:21
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lcl211

铜虫 (小有名气)
谢谢大家
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5楼2009-05-17 10:05:32
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