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汕头大学海洋科学接受调剂
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yanglzlz

铜虫 (小有名气)

[求助] 紫外和荧光算出来是一样的是正常的吗? 已有1人参与

大家好,我是一个计算化学新手,最近在关于UV光谱和荧光光谱方面有一些疑问想请教各位大神:荧光光谱如果选择了#opt td=(nstates=3) b3lyp/6-31g方法,UV是#opt td b3lyp/6-31g方法,我想问一下这么计算是可以的嘛?但是发现结果是一样的啊,nstates默认就是3,难道紫外和荧光是一个结果吗?拜托有懂的大神可以给指点迷津
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paramecium86

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【答案】应助回帖

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yanglzlz: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2019-03-11 15:51:57
楼主给的这两种写法其实是完全一样的 因为 高斯的TD 默认选项就是Nstates=3 写与不写是没有区别的 所以这两种算完结果肯定完全一样。

简单来说,区分荧光(发射光谱)还是UV(吸收光谱)的区别是起始态是激发态还是基态。荧光光谱 起始态是激发态 那么就应该针对激发态进行优化之后 再计算荧光的各种参数。那么就如同楼主给出的输入文件一样。需要 opt 和 td命令 同时使用。这样高斯就会针对第一激发态优化。算出来就是荧光光谱

如果需要计算UV 吸收光谱,那起始态就是基态。需要第一步对基态进行优化 然后第二步读取第一步生成的chk文件再单独运行一次TD。

举个例子
第一步的计算的输入文件

%nproc=
%mem=
%chk=step1.chk
#  OPT B3LYP/6-31g

title 行

电荷呀 多重度呀
分子坐标等等


第二步
%nproc=
%mem=
%chk=step1.chk     
#P TD b3lyp/6-31g  guess=read geom=allcheck
这之后啥都不用写了 程序会自动读取chk里的信息。
2楼2019-03-11 11:06:09
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yanglzlz

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-11 11:06:09
楼主给的这两种写法其实是完全一样的 因为 高斯的TD 默认选项就是Nstates=3 写与不写是没有区别的 所以这两种算完结果肯定完全一样。

简单来说,区分荧光(发射光谱)还是UV(吸收光谱)的区别是起始态是激发态还 ...

太感谢你的回答了!我还有一些基础的问题想请教一下,第二步的p是什么意思呢,还有后面两个语句(guess=read geom=allcheck)代表什么意思呢。
还有就是荧光的计算文件是算完紫外的输出文件吗?
问题可能有些幼稚,还是新手不太明白,期待你的回复!
3楼2019-03-11 11:15:08
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paramecium86

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引用回帖:
3楼: Originally posted by yanglzlz at 2019-03-10 22:15:08
太感谢你的回答了!我还有一些基础的问题想请教一下,第二步的p是什么意思呢,还有后面两个语句(guess=read geom=allcheck)代表什么意思呢。
还有就是荧光的计算文件是算完紫外的输出文件吗?
问题可能有些幼稚 ...

荧光 和 紫外是单独两个不同的计算。无论是分子结构 还是 分子轨道的信息都不一样。紫外的输出文件 对于荧光的计算不会有特别大帮助。最多就是紫外计算输出的分子结构 可以用做荧光计算的初始结构。但是最后荧光优化之后一定是得到不一样的结构 和 分子轨道信息。

#p 这里的p可以不用加的。加或者不加 完全不影响计算结果。只会影响输出文件会输出多少details。

至于命令的含义 我一句两句话肯定说的没有官网上好 也没有那么细致。还是给你官网三个链接
http://gaussian.com/route/     这里有#p的具体含义   
http://gaussian.com/guess/     这个是 guess命令的含义和用法
http://gaussian.com/geom/    这个是 geom命令的各种含义用法

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4楼2019-03-11 12:01:32
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yanglzlz

铜虫 (小有名气)

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引用回帖:
4楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-11 12:01:32
荧光 和 紫外是单独两个不同的计算。无论是分子结构 还是 分子轨道的信息都不一样。紫外的输出文件 对于荧光的计算不会有特别大帮助。最多就是紫外计算输出的分子结构 可以用做荧光计算的初始结构。但是最后荧光优 ...

谢谢~我这么理解对吗,其实我最开始问题中列出的荧光算法是可以的,算出来直接是优化激发态后的。但是紫外应该改成分为两步算,第一步opt算完只重新编辑gif 文件里#后面的,生成的chk和log的都不用动,会在文件夹自动更改。是这样的嘛?
5楼2019-03-11 15:05:35
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paramecium86

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引用回帖:
5楼: Originally posted by yanglzlz at 2019-03-11 02:05:35
谢谢~我这么理解对吗,其实我最开始问题中列出的荧光算法是可以的,算出来直接是优化激发态后的。但是紫外应该改成分为两步算,第一步opt算完只重新编辑gif 文件里#后面的,生成的chk和log的都不用动,会在文件夹自 ...

嗯 是的
你之前问题里列出的是算荧光用的。     
要算紫外吸收 那就是分两步。 第一步opt完之后  最简单方法就是 按照我之前贴出来的那个 直接编辑gjf文件的命令行部分, chk log不用管 第二步会自动把它们都覆盖掉。如果你不想第一步的log文件被第二步覆盖掉 那第二步的gjf就需要换一个文件名另存为一下, 到时候算完就会生成一个新的文件名的log文件。

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6楼2019-03-11 15:38:36
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yanglzlz

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引用回帖:
6楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-11 15:38:36
嗯 是的
你之前问题里列出的是算荧光用的。     
要算紫外吸收 那就是分两步。 第一步opt完之后  最简单方法就是 按照我之前贴出来的那个 直接编辑gjf文件的命令行部分, chk log不用管 第二步会自动把它们都覆 ...

懂了!谢谢你认真详细的回答!
7楼2019-03-11 15:51:30
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