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jiangyue8558

铜虫 (小有名气)

[交流] 荧光定量PCR数据分析

我的实验设计是二个品种的猪种:品种A和品种B。共有5个营养水平:1,2,3,4,5.每个营养水平有4头猪。其中品种A有营养水平1,2和3;B有营养水平2,3,4和5.分别做了7个基因在7个组织中的荧光定量表达。每个都做了三个重复。在数据计算时,目的基因减去看家基因得出的值有的为正的,有的为负的。如果用2-△△Ct法计算,我不知道该把哪个作为对照组(是把某个猪种的某个营养水平做为对照,也即是把这一营养水平的所有组织都分别作为对照);还是选某一个营养水平的某一个组织作为对照,其它的所有营养水平和组织都跟它相比较呢?我本来准备用△CT作柱状图的,可是因为有的是负值,所以不知道哪个数值可以做为表达值。我看文献大部分都只是一个实验组和一个对照组,分析时很直接,直接用实验组减去对照组就行了。
大家帮分析分析。
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jiangyue8558

铜虫 (小有名气)

希望大家多给点议哈,做过的就更好了
6楼2009-05-11 20:34:03
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


jiangyue8558(金币+1,VIP+0): 5-11 21:37
算法归算法,始终得看你的实验目的
你的实验目的到底是想拿什么跟什么比较呢?
2楼2009-05-11 19:30:14
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jiangyue8558

铜虫 (小有名气)

1.可以得出不同基因在不同组织的表达量差异
2.不同猪种中基因表达差异
3.不同营养水平基因表达差异
3楼2009-05-11 19:36:46
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
jiangyue8558(金币+2,VIP+0):谢谢 5-11 20:00
1、那就很简单了,这里的唯一变量就是组织,其他的(品种、营养)都必需一致
然后,随便你挑一个处理组当对照(也就是设为1、100,whatever you like)
2、知道1就知道2怎么弄了
3、同上
4楼2009-05-11 19:39:36
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