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MS做膜中气体扩散模拟结果偏差大
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| 我最近在尝试参考文献中的流程用MS进行高分子膜中气体扩散的模拟，流程如下：建立cell--几何优化--NPT200ps--退火nvt1ns--nvt2ns用于分析轨迹，最终得到的结果中，水和水合氢离子的扩散系数都略大于参考值，但气体的大了3倍，之前用更短的流程模拟时，误差反而还小一些，请问可能是什么原因造成的？另外还有两个小问题想请问大家，我的高分子是直接画的，直接画的和用buildpolymer建模有区别吗？因为看起来形状差异很大，但buildpolymer建的高分子链和其他分子一起放入cell中，几何优化一直达不到收敛标准，请问这可能是什么原因呢？新手金币少，还请大家多多指教。 |
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