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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】如何获得分子的对称性(点群)?谢谢!

请问各位,如何快速地获得一个分子的对称性(点群)?

由于没有该方面的理论基础,所以想问一下,有没有软件可以给出任意分子的对称性呢?

谢谢!!
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★ ★ ★ ★
snoopyzhao(金币+3,VIP+0):谢谢!能说说如何从 Gaussian 中获得点群吗? 5-10 14:35
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-10 21:25
很多程序都可以,例如gaussview,MacMolPlt,gaussian,adf,...

这里还有个用c写的程序

http://www.ualberta.ca/dept/chemistry/computational/symmetryDIR/
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2009-05-10 13:08:44
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

另外,某一分子的点群是不是与所输入的原子位置有很大关系?

谢谢!!
3楼2009-05-10 14:36:25
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
snoopyzhao(金币+1,VIP+0):谢谢你提出的技巧! 5-10 14:56
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-10 21:25
我觉得分子的点群完全取决于所输入的坐标。

如果你用高斯,可以给你的分子算一个PM3单点能,很快就能做完,然后输出文件的“Frame”一行就给出对称性类型了。
4楼2009-05-10 14:43:16
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-10 21:25
随便算一个什么都可以得出分子点群的
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
5楼2009-05-10 18:39:17
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neweroica

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 呵呵 强人 5-10 21:26
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 5-11 17:38
这是我以前写的一个判断分子点群的程序:

http://202.112.86.128/studentspace/aqyw/cpp/Cartes/PG.rar
Simpler, stronger, more tolerant
6楼2009-05-10 18:51:54
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by neweroica at 2009-5-10 18:51:
这是我以前写的一个判断分子点群的程序:

http://202.112.86.128/studentspace/aqyw/cpp/Cartes/PG.rar

显示错误啊,呵呵……

不过好像在什么地方见过,紫霞?
7楼2009-05-10 18:53:55
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jjf_sxnu

铜虫 (正式写手)

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-10 21:29
snoopyzhao(金币+1,VIP+0):谢谢!如果可能,发一份给我吧。 5-11 07:47
如果你用的是Linux,我可以给你一份我自己写的程序,包括了识别与调节对称性。
8楼2009-05-10 21:23:46
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zhaohscas1976

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢! 5-11 09:04
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢! 5-11 09:04
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 5-11 17:38
比较方面的工具是material studio 的visulizer ,就是它的gui 界面
。

一看便知。

还可以自动发现对称性,求原胞等等。
引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2009-5-10 12:41:
请问各位,如何快速地获得一个分子的对称性(点群)?

由于没有该方面的理论基础,所以想问一下,有没有软件可以给出任意分子的对称性呢?

谢谢!!

9楼2009-05-11 00:14:19
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢! 5-11 09:04
lei0736(金币+1,VIP+0):转移 5-11 17:38
引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2009-5-10 14:36:
另外,某一分子的点群是不是与所输入的原子位置有很大关系?

谢谢!!

有关系,这是因为大多数程序写的不够聪明。不过有的程序可以自动转动分子,从而得到最高的对称性。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
10楼2009-05-11 04:49:38
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