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ppshanshanqiu

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】OH自由基进攻氯苯反应路径

想做OH自由基进攻氯苯的一个反应路径,现在找到了一个过渡态如图ts所示,即OH同C之间的距离缩短,c-cl键深长,并且Cl开始偏离苯环平面,该过度态有且仅有一个虚频,振动显示是O与C之间距离缩小,做了前后IRC,发现得到的第一个构型是图1所示,第41个构型如图41所示,它之前一直以为这个构型是错的,后来有人说这个前后只是相对意义,并不一定第一个构型就是对应反应物的,最后一个对应产物的,不知道这种解释对不对。
   假如上述找的过渡态是正确的,我在这个过渡态上做了个基态优化,得到没有虚频的一个结构,可不可以认为这个就是所谓的一些反应路径中应该出现的中间产物IM1,假设上述做法都是正确的,接下来我应该怎么做呢,在OH加上后是不是还存在一个脱氯的过渡态呢,还是这两个就是协同的呢?如果存在这个过渡态,我应该在上述IM1的基础上找吗?
   另外在有些计算反应路径的势能面图上经常能看到从反应物出发,会经历好几个过渡态到达IM1,比如S0-TS1-TS2-IM1,不知道这个TS2怎么做出来的,是在S0的基础上找的还是从TS2的基础上找的呢?又或者说寻找过渡态有时候是不是并不是唯一的?
  初学路径计算,好多东西不懂,求达人请教

[ Last edited by ppshanshanqiu on 2009-5-7 at 11:48 ]
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ppshanshanqiu

铜虫 (小有名气)

btw,我找到的虚频位置是389.78i
2楼2009-05-07 11:41:14
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-9 13:38
如果你找到的这个是TS1,那么TS2就应该是TS1的产物与最终产物之间的过渡态。

过渡态这个东西可不好找,但是发现好多文章中都有,不知道这些高手们是怎么寻找过渡态的啊

希望在这方面有经验的同志们能不吝赐教啊!
3楼2009-05-07 15:59:02
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ljfyf

铜虫 (小有名气)


loovfnd(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与! 5-7 19:59
建议看下这篇文章!
Quantum Chemical and Kinetic Study of Formation of 2-Chlorophenoxy Radical from 2-Chlorophenol: Unimolecular Decomposition and Bimolecular Reactions with H, OH, Cl, and O2
J. Phys. Chem. A 2008, 112, 3680-3692
4楼2009-05-07 16:46:51
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ppshanshanqiu

铜虫 (小有名气)

感谢ls,好好拜读下这篇
5楼2009-05-08 10:25:32
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sealanlan

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 鼓励新人发言 5-9 13:38
你可以做三个过渡态判断一下这个究竟是不是协同反应
1。H-O靠近C,形成H-O-C而C-Cl键不断裂,这时的过渡态为TS1
2。H-O靠近C,Cl离去,然后形成H-O-C键,这时的过渡态为TS2
3。H-O靠近C,形成H-O-C键的同时,C-Cl断裂,这时的过渡态为TS3
如果TS3比TS1和TS2都小,即说明此反应为协同反应。
6楼2009-05-08 10:36:38
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ppshanshanqiu

铜虫 (小有名气)

十分感谢楼上的回答,试试看,呵呵
7楼2009-05-13 22:37:18
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