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2009云飞扬铁杆木虫 (著名写手)
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lammps中某个区域压强的求解
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各位朋友,还是前面提到过的一个问题。我建立了一个立方体,中心挖去原子形成一个球孔,在球孔中填入了另一种原子A,想求解球孔区域A原子所形成的压强是多大,目前知道应该局部压强采用compute stress/atom 来计算(单位是能量——压强.体积),但是这样就需要求解球孔区域A原子所形成的体积有多大,计算体积目前是采用的compute voronoi/atom 指令。但是在计算过程中总是觉得体积算的不对,相关的具体化指令如下,请知道的朋友帮忙指点指点,应该怎么计算才能正确得到。先谢谢啦。 compute stress voidA stress/atom He_bubble compute stress1 voidA reduce sum c_stress[1] compute stress2 voidA reduce sum c_stress[2] compute stress3 voidA reduce sum c_stress[3] compute volum voidA voronoi/atom only_group variable p equal -(${c_stress1}+${c_stress2}+${c_stress3})/(3.0*c_volum) 体积计算部分是不是有问题呢?希望知道的朋友能够详细说说,先谢谢啦 |
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| 印象中compute voronoi/atom是唯一计算体系部分原子体积的方法,这个算法有些思路清奇,严格上说可能不太准确,可我用过一次,觉得精度还行。但在用之前你总要知道这个命令输出了什么东西吧。刚才简单看了一下手册,我有些记不清了,只能大致说一下当时是怎么做的。1)voronoi体积不是真正的体积,所以你是不是要V(总体积)*voronoi(A原子)/voronoi(所有原子)来得到A原子的体积? 2)我记得这个命令输出的不是单个的数,而是数组,好像还是二维数组,所以你是不是应该输出到一个文本看看它的输出格式,把其中一个数组所有的结果加起来,甚至为了结果准确,还要做一个系综平均 |
9楼2019-03-12 14:36:24
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