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【求助】IRC的输入文件错在哪里了?
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Number 0 Base 40448 End 65536 End1 65536 Wr Pntr 40448 Rd Pntr 40448 Length 25088 Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO. 我是在LINUX下算的，按理说不存在内存的问题，后来我把Gausstmp下的文件都删了，就是安高斯的时候设的临时文件夹，可是还是不好用。出现一样的错误，后来我也尝试了再重新加任务,可是还是不可以,我的输入文件如下:希望大家帮帮忙! %chk=/home/def/irc/lin-ts2 %mem=1500MB %nproc=4 # irc=(maxpoints=100,calcfc,maxcycle=500) b3lyp gen pseudo=read irc-lints2 0 1 P 3.26681700 -1.22585300 -1.32329200 H 2.96098400 -2.02076500 -2.47984900 H 4.02233900 -2.25968000 -0.68232300 H 4.41708800 -0.61627200 -1.92593800 Pd 1.65054600 0.07186900 0.20097500 C 2.84539600 -0.04701000 2.09830000 C 1.81499800 -1.02405100 2.10903100 H 2.67127600 0.93352700 2.53318100 H 3.88225800 -0.36851400 2.07027800 H 2.08398300 -2.06936100 1.96454700 C 0.46293700 -0.66442600 2.03658400 H 0.11896400 0.29834200 2.40418500 H -0.29951900 -1.41989800 1.88349000 C 1.09524300 1.62830800 -1.37239800 C 0.02658600 0.66202500 -1.23276900 H 1.71535300 1.52464300 -2.26252900 C -1.29325000 0.91583000 -0.61402400 H -0.01558000 -0.04674700 -2.05701900 C -2.22752300 -0.17150100 -0.42720000 C -1.70972200 2.19782900 -0.27321000 C -3.53597900 0.10126300 0.09477400 C -1.90449200 -1.52083200 -0.73651900 C -2.99222000 2.45475400 0.25927700 H -1.04632300 3.03593600 -0.45632500 C -3.89330000 1.43247300 0.44113600 C -4.45649700 -0.96918700 0.25866500 C -2.82020500 -2.53858300 -0.56569500 H -0.90816300 -1.75679600 -1.09344600 H -3.26696100 3.47727700 0.50636900 H -4.88652900 1.62564600 0.83906300 C -4.11404500 -2.26194300 -0.06758000 H -5.44575300 -0.74436900 0.65128400 H -2.54397800 -3.56105500 -0.81062500 H -4.83016300 -3.06905300 0.06260300 C 1.54259300 2.51383100 -0.41155100 H 0.95822000 2.77127700 0.46417200 H 2.44203900 3.09499800 -0.58750500 H 0 6-31g **** C 0 6-31G(d) **** C 0 d 1 0.8 **** Pd P 0 lanl2dz **** P 0 d 1 0.34 **** Pd P 0 lanl2dz --Link1-- %Chk=/home/def/irc/lin-ts2.chk *我把以前的.CHK文件复制到这个文件夹* %Save # opt=(calcfc,ts,maxcyc=900) scf(maxcyc=400) freq b3lyp gen pseudo=read iop(5/13=1,9/6=150,1/11=1)*这是原来算过渡态时的输入* [ Last edited by handongxue1011 on 2009-5-5 at 16:53 ] |
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2楼2009-08-10 08:45:40
dummy1
木虫 (正式写手)
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3楼2009-08-10 19:33:02
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lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 8-10 20:09
handongxue1011(金币+5,VIP+0):太谢谢你了,解了我一大心理疾病 8-14 08:47
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 8-10 20:09
handongxue1011(金币+5,VIP+0):太谢谢你了,解了我一大心理疾病 8-14 08:47
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看不太明白。 过渡态优化及频率计算应该在irc计算之前进行啊，怎么放在irc之后呢？ 按照我的经验，这个错误应该是irc计算中读取chk文件失败。以我之愚见，先做ts优化及频率计算，然后复制chk文件并重命名，然后以新的chk文件作为irc计算的chk文件，force constant matrix和坐标都可以从chk文件中读取（irc=rcfc geom=checkpoint），这样做就可以避免上述错误了。 [ Last edited by liqx on 2009-8-10 at 20:05 ] |
4楼2009-08-10 20:04:26
