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lammps real单位时间步问题
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我用real默认的时间步模拟我的系统时模型变形比较大。导致原子miss。当我调小时间步时就没有这种情况。请问这是什么原因导致的呢。感谢老师同学们帮忙! 发自小木虫IOS客户端 |
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各位老师好,求调剂,本科211,一志愿天津大学生物与医药学硕,差两名录取。
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恭喜你,都学会抢答了,看到你这问题的时候我都懵了。一般而言讨论到步长这里我觉得就够了。再深究的话,以下是我的浅见,我推测就是跟运动方程积分算法有关,你要知道MD里面的时间是离散的,而不是连续的,最小的单位就是步长,没有比步长更短的时间。考虑一个原子的运动,在两个单位步长内,力场决定加速度,而速度的积分是位移,自然是步长越大,位移越大,那么位移太大的原子可不就跑到盒子外面了吗。唯一一点我没搞懂的就是为什么周期性盒子中原子会丢失,也就是说可能原子位移是有上限值的,超过位移上限的原子即使在周期性边界条件下一样会丢失 发自小木虫Android客户端 |
2楼2019-01-13 23:58:31
3楼2019-01-14 18:02:15














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