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虚拟筛选遇上高通量筛选？ 已有1人参与
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新药研究属于高科技领域,世界各国对新药研究的投入逐年增加。据统计,1981年全世界对r&d投入为52亿美元,至1996 年已达到450亿美元。虽然新药研究开发的投入逐年增加,但每年上市的新的一类新药(nce)却逐年减少,60年代初期,每年上市的nce约100 个,1996年仅40个,由此可见，平均每一个新药的成本亦大幅度的增加。 人类基因组计划的完成以及后续功能基因组(结构基因组、蛋白质组和代谢组等)计划的实施,深刻地改变了药物研究和开发的思路及策略,形成了新药研究的新模式--从基因组到药物(fromgenome to drug)，包括新靶标的发现与确证、先导化合物的发现与优化以及药物开发。其中，先导化合物的发现过程中，常用的筛选方式有高通量筛选(high throughput screening，hts)和虚拟筛选(virtual screening，vs)。 高通量筛选(high throughput screening，hts)技术是以分子水平和细胞水平的实验方法为基础，以微板形式作为实验工具载体，以自动化操作系统执行试验过程，以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据，以计算机分析处理实验数据，在同一时间检测数以千万的样品，并以得到的相应数据库支持运转的技术体系，简言之就是可以通过一次实验获得大量的信息，并从中找到有价值的信息。 但传统的高通量筛选遇到许多问题，一是药理测试假阳性与假阴性结果；二是化合物样品来源短缺；三是通用性不高，很多hts方法只对一种或几种酶具有适应性；四很多高通量筛选方法中所用到的试剂和仪器都非常昂贵，很多实验室都无法配备，而与大型制药企业相比，大部分科研单位没有这样的经济实力。 虚拟筛选(virtual screening，vs)是指基于药物设计理论，借助计算机的技术和专业应用软件，从大量化合物中挑选出一些有苗头的化合物，进行实验活性评价的一种方法。其目的是从几十个乃至百万个分子中筛选出新的先导化合物。这种药物筛选方式不消耗样品，降低了筛选的成本，还考虑化合物分子药动学性质和毒性，增加筛选的内涵。并且缩短了新药研发周期，降低了直接研发费用，相比于高通量筛选，虚拟筛选不存在样品限制。 药物筛选过程涉及化合物资源库、虚拟筛选结果、实体筛选化合物的选取、实体筛选模型、实体筛选数据管理等。实体筛选包括分子水平、细胞水平、动物水平等不同层次的筛选数据管理。筛选过后的大量数据如果管理不善，必定会制约中心药物筛选的发展，也不利于后期的审计核查及数据分析。然而目前市场上的筛选软件大多不具备数据管理这一项功能，难以满足需求。而药物筛选管理系统（dsms）综合虚拟筛选与实体筛选的药物筛选数据管理系统，内置化合物资源库，为大规模化合物高通量筛选提供数据管理一站式解决方案，加速药物发现。 |
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2楼2019-01-07 14:59:39
