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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】构建分子结构
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】构建分子结构

刚接触MS，按照教程走了几个例子。现在想自己构建或者画几种分子的结构。比如简单一点的氮气的结构：氮氮三键，键长约为1.20A。氮氮三键在3D Atomistic.xsd中很容易画出，但是这键长要确定为1.20A就有点困难了。Filter--bond里不能够直接更改，只能通过拖来确定吗？还有没有其他更简单一点的方法来直接改变键长？
初学者，问题有些简单，请大家不要见笑，谢谢！！

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-20 at 13:55 ]
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1楼 2009-05-03 16:38:19
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢 5-3 23:38
这个是量子力学的值？
分配合适的力场参数，minimize一下，自然就变成1.2了
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2楼2009-05-03 20:59:52
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xiangqing

银虫 (初入文坛)
你可以改变两个N原子的坐标
进而可以改变键长咯！！
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3楼2009-05-04 09:33:20
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jw88989

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiangqing at 2009-5-4 09:33:
你可以改变两个N原子的坐标
进而可以改变键长咯！！

但是你要怎样才能正确的改变原子坐标使得正是我需要的键长呢
赞一下 回复此楼
4楼2009-05-04 10:03:15
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by jw88989 at 2009-5-4 10:03:

但是你要怎样才能正确的改变原子坐标使得正是我需要的键长呢

同问。
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5楼2009-05-04 13:45:47
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
★ ★ ★
wuli8(金币+3,VIP+0):xiexie 5-4 21:49
clean一下
不一定非要构建的和实验值一样吧
如果都那样还要优化干嘛呢
实验上时1.20，那是在有限温度下的，dmol是零温静态啊
应该可以调节键长的精确长度
用精确移动就可以
赞一下(10人) 回复此楼
快乐科研，快乐生活。
6楼2009-05-04 14:26:27
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