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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】MP2方法和大基组算较大的体系
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【求助】MP2方法和大基组算较大的体系

上个月投稿了一篇用DFT理论基于B3LYP/6-311++G(d,p)基组计算催化反应机理的文章，审稿意见回来了，建议用MP2方法算一下弱的相互作用体系，然后和DFT方法比较。

我的催化剂比较大，加上反应物在MP2方法下采用6-31+G(d)基组，都不能算下去了。看了输出文件提示是磁盘空间不够。我的硬件是没有问题的，性能比较高的64位的电脑，但是我的gaussian版本是32位的，磁盘空间最多仅仅调用16G，请问高手怎么能扩充gaussian调用得磁盘空间？改装64位的gaussian软件行吗？

我看见有的资料上说MP2方法如果采用小的基组是很不合理的，它需要和较大的基组联用，但是大的体系用MP2方法还想用较高精度的算法怎么办？请高手指点一二，目前很着急啊。
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乐观、执着、勤奋
1楼 2009-05-01 08:36:07
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recoli

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
majun04(金币+1,VIP+0):已经尝试了，这个方法不行的。 5-1 15:20
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-3 18:02
可以考虑采用Direct算法，减小硬盘需求量，但是内存要够大。也可以使用MaxDisk选项。
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2楼2009-05-01 10:44:00
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★ ★ ★
majun04(金币+1,VIP+0):审稿人的要求是要用MP2补充数据，感觉也想按要求补充一点。 5-1 15:19
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 5-3 18:02
如果分子不是太大，可以考虑用aces2、molpro、molcas、turbomole一类的程序，mp2计算比gaussian快得多。
还可以用ri-mp2方法，效率会提高一个数量级以上。
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2009-05-01 12:24:21
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zyy816

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
majun04(金币+2,VIP+0):谢谢你，现在正想办法弄个64位的gaussian试试呢 5-1 15:19
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-3 18:02
如果一定要用gaussian计算，大空间要用64位的g03，最好在linux下面计算
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4楼2009-05-01 12:48:07
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madonion

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
majun04(金币+1,VIP+0):谢谢你，maxdisk已经用过也不行，可能体系太大了。ri-mp2以后用，现在先按照审稿人的要求补数据。 5-1 18:53
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 5-3 18:02
MP2不用大基组没啥意思。要是用gaussian的话用maxdisk限制一下硬盘否则大体系硬盘肯定不够

还是推荐用ri-mp2能快不少，我用turbomole
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5楼2009-05-01 18:19:08
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suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫
★ ★ ★
majun04(金币+1,VIP+0):嗯，谢谢你，已经这么打算了。 5-1 18:51
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-3 18:02
64位的gaussian不限制磁盘空间的，建议用64位的gaussion，最好在linux系统下计算
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做中国人的化学！！！！
6楼2009-05-01 18:50:20
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 5-3 18:03
不错啊，希望有更多的人加入到小木虫的行列中来，为别人服务，即是为自己服务啊
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7楼2009-05-01 21:34:57
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majun04

木虫 (著名写手)

majun
改成用64位的gaussian计算以后，发现以前用32位计算不通过的文件的确通过了。
但是有一个问题不理解的是：
在32位上不通过，磁盘空间不够，读写文件出错。32位的gaussian只能调用16GB磁盘空间，那么推断计算文件需要的磁盘空间是超出了16GB。
在64位上计算的时候，发现，读写文件（临时文件）根本就没有超过16GB啊。
难道同一个文件在32位和在64位gaussian下计算，产生的读写文件大小不一样吗？
比较困惑，请高手指点。
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乐观、执着、勤奋
8楼2009-05-02 17:39:34
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-3 18:03
看看编程和内存管理基础, 你就知道了,,,,,, 64位或者128位技术, 优势在哪里????
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
9楼2009-05-02 18:14:41
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 5-5 08:38
引用回帖:
Originally posted by majun04 at 2009-5-2 17:39:
改成用64位的gaussian计算以后，发现以前用32位计算不通过的文件的确通过了。
但是有一个问题不理解的是：
在32位上不通过，磁盘空间不够，读写文件出错。32位的gaussian只能调用16GB磁盘空间，那么推断计算文件 ...

计算刚开始的时候并不一定需要很大的硬盘容量，可能你看的时候正好是rwf文件较小的那一段，一般来说如果只作MP2优化计算，硬盘容量需求不是很大，但到了频率计算时，对硬盘的需求会暴涨，有时多10倍都不止。
另外64位程序有时需要的硬盘空间的确跟32位的不一样。
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
10楼2009-05-03 20:37:23
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