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lammps fix rigid 命令模拟CO分子运动
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我用下面的输入文件运行第二步就出现原子丢失，请教下是什么原因，fix rigid 针对气体分子的体系要怎么用，ERROR: Lost atoms: original 200 current 192 (../thermo.cpp:430) units metal boundary p p p atom_style full read_data CO.data kspace_style ewald 0.00001 special_bonds lj/coul 0.0 0.0 1.0 pair_style lj/cut/coul/long 8 bond_style harmonic bond_coeff 1 1400 1.13 #C-O pair_coeff 1 1 0.0011 3.83 8 #C-C pair_coeff 2 2 0.0069 3.12 8 #O-O neighbor 2.0 bin neigh_modify every 1 delay 0 check yes velocity all create 300 56789 rot yes mom yes dist gaussian units box fix 1 all rigid/nvt/small molecule temp 300 300 100 thermo 1 thermo_style custom step temp pe etotal press vol timestep 1 dump 1 all custom 1 dump.lammpstrj id type x y z dump_modify 1 sort id run 2000000 |
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