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守口如瓶1

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【怪想】DNA会是双链平行的吗?

DNA双链反向平行,一条5‘到3’,一条3‘到5’,这是经典。

在DNA复制,转录,翻译时都有方向性,这个俺无异议。

      假设有这样一种情况,DNA变性后成单链,加入一种引物,而引物却是和单链正向互补配对,而不是通常的反向互补配对,引物还会结合上去吗?如果结合不上去,那么原因是什么了?结合上去了话,加酶延伸后,可以得到稳定的双链吗?
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695

木虫 (职业作家)

只要你能证明就是真的
2楼2009-04-29 18:14:41
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edwardwtfl

木虫 (正式写手)

很好的idea啊!!
[img]http://www.discuz.net/images/logo.gif[/img]
3楼2009-04-29 18:21:17
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

理论上好像没错啊,可以花点钱做做看。
ps:RT-pcr设计引物就是都与正义链配对吧。
Thank-you,so-blue.
4楼2009-04-29 21:50:03
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守口如瓶1

铁虫 (初入文坛)

呵呵,谢谢关注哈,还请大家多多讨论下

      似乎有实验表明,没有双链DNA合成出来,但引物有没有结合上去未做说明,是引物未结合造成的还是聚合酶的特异性造成的,还是不稳定造成的,不知道。能做解答的同胞们还请多多解释下原因吧!

回复楼上的,RT-PCR和我讨论的问题没有关系,它的引物设计还是遵照经典拉。

此怪想来自《Genetics》ROBERT J BROOKER       second edition   P305 习题8
5楼2009-04-30 11:00:46
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seahow

木虫 (著名写手)

楼主能提供《Genetics》ROBERT J BROOKER       吗?
我对结构想象力差,但我觉得可能和手性有关,所以还是可能是反向互补,讨论。
6楼2009-04-30 11:40:18
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sjs511788199

金虫 (正式写手)

你试试就知道的
7楼2009-04-30 15:49:22
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seahow

木虫 (著名写手)

我看了原题,本题是对染色体易位等的练习;属于经典遗传范畴,而。

楼主敢想的idea,
8楼2009-04-30 16:07:03
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wangtengxu

木虫 (正式写手)

偶想反问一下:
您是想从3‘往5’合成吗
有这样的酶吗?

关注!
想和有趣的人一起做有趣的事。
9楼2009-04-30 17:36:45
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守口如瓶1

铁虫 (初入文坛)

首先,申明一下《Genetics》ROBERT J BROOKER   second edition   P305 习题8 是属于分子遗传学的,不属于传统的transmission genetics,本章的标题是DNA的复制。有兴趣的朋友可以看看原题,我的问题是在题目基础上的延伸。

    另外,回复楼上的,我没有说合成的方向是3'到5'啊!

下面是举的例子:

模板5'-ATACGGGACTAGGCCGGAGGTCCGGGCGAAAAAAAAAAA-3'

设计有一经典反向互补引物是5'-CGCCCGGACC-3'

讨论的引物是5'-CCAGGCCCGC-3',正向互补,会和模板结合吗?在酶的作用下会延伸合成DNA双链吗?
10楼2009-05-01 02:05:28
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