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用xcrysden直接可视化POSCAR或OUTCAR里原子结构的方法
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写了2个bash脚本文件pos2xsf.sh和voutcar2xsf.sh。 pos2xsf.sh可将POSCAR(或CONTCAR.支持vasp5.x和vasp4.x)转换为xsf格式的输出。 voutcar2xsf.sh可取出OUTCAR里的原子坐标构型并按xsf格式输出。 这两个脚本文件可以从如下的网址上下载： https://github.com/houzf/poscar2xsf 或在附件中poscar2xsf.tar.bz2解压（解压命令：tar xjvf poscar2xsf.tar.bz2)后得到。 然后通过在xcrysden的自定义文件custom-definitions里添加如下设置（注意your_username需被替换为你真实的用户名）： addOption --vasp /home/your_username/bin/pos2xsf.sh { load structure from vasp file format } addOption --outcar /home/your_username/bin/voutcar2xsf.sh { load structure from vasp file format } 然后运行xcrysden命令添加参数，比如按如下方式来运行： xcrysden --vasp POSCAR xcrysden --outcar OUTCAR |
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2018-12-14 16:20:03, 77.75 K
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