| 查看: 6141 | 回复: 15 | ||||||
| 【奖励】 本帖被评价9次，作者valenhou001增加金币 6.8 个 | ||||||
[资源]
用xcrysden直接可视化POSCAR或OUTCAR里原子结构的方法
|
||||||
|
写了2个bash脚本文件pos2xsf.sh和voutcar2xsf.sh。 pos2xsf.sh可将POSCAR(或CONTCAR.支持vasp5.x和vasp4.x)转换为xsf格式的输出。 voutcar2xsf.sh可取出OUTCAR里的原子坐标构型并按xsf格式输出。 这两个脚本文件可以从如下的网址上下载： https://github.com/houzf/poscar2xsf 或在附件中poscar2xsf.tar.bz2解压（解压命令：tar xjvf poscar2xsf.tar.bz2)后得到。 然后通过在xcrysden的自定义文件custom-definitions里添加如下设置（注意your_username需被替换为你真实的用户名）： addOption --vasp /home/your_username/bin/pos2xsf.sh { load structure from vasp file format } addOption --outcar /home/your_username/bin/voutcar2xsf.sh { load structure from vasp file format } 然后运行xcrysden命令添加参数，比如按如下方式来运行： xcrysden --vasp POSCAR xcrysden --outcar OUTCAR |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : poscar2xsf.tar.bz2
2018-12-14 16:20:03, 77.75 K
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 精华网帖收集 | dft_vasp | 第一性 | 第一性原理 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
前田庆次» 猜你喜欢
基金委咋了？2026年的指南还没有出来？
已经有4人回复
-
纳米粒子粒径的测量
已经有8人回复
-
疑惑？
已经有5人回复
-
国自然申请面上模板最新2026版出了吗？
已经有14人回复
-
计算机、0854电子信息（085401-058412）调剂
已经有5人回复
-
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有5人回复
-
溴的反应液脱色
已经有7人回复
-
推荐一本书
已经有12人回复
-
基金申报
已经有4人回复
-
常年博士招收(双一流，工科)
已经有4人回复
2楼2018-12-14 16:29:43
3楼2018-12-14 17:51:44
6楼2018-12-14 20:00:48
8楼2018-12-14 23:38:47
9楼2018-12-15 07:57:07
10楼2018-12-16 22:48:47
13楼2019-02-25 20:45:07
14楼2019-02-25 20:45:54
简单回复
2018-12-14 19:51
回复
五星好评 支持！
漫天飘雪5楼
2018-12-14 19:54
回复
五星好评 
2018-12-14 21:10
回复
五星好评
tonglijia11楼
2018-12-17 17:03
回复
五星好评 
qinjy12楼
2018-12-20 00:00
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
dahuchang15楼
2020-04-06 14:36
回复
一般 顶一下，感谢分享！
河外星云16楼
2023-10-11 12:52
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！