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QM/MM方法求助
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最近在通过gromace和gaussian做离子液体的QM/MM模拟,在网上找了几个mdb文件,发现都不一样,特此来问一下,做这个时的mdp文件的各个参数应该怎么设置? 下附两个在网上找的mdp,发现其都不一样。应该参照哪个?另外,那个Reaction-Field是必须用的吗?我看有人用cut-off有人用这个,如果用Reaction-Field参数应该怎么设置?如果用cut-off,参数又应该怎么设置呢? 先谢过各位了 |
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