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laohaoren2802

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】discover运行问题,请高手帮忙,谢谢!!!

在运行Discover—Dynamics时,具体参数选择为:
ensemble---NVE;
Temperature—300K;
number of steps——200000;
time step—1.0;
dynamics time—200.0;
save—full;
frame output every—250
点击Run后,可以运行。
但是当运行一段时间后就停留在那一步不动了,无法进行后面的计算,而Jobs explorer中status栏仍显示为:running。
下面是status.txt中部分信息,从这之后等了40多分钟后还是这样,毫无进展,也没提示错误:
Operation: dynamics
  Temperature    312K
  Step         27068
  Sim Time     27068fs
  CPU Time   0:15:37
不知道是什么原因,请高手指点,谢谢!!!
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qasd

木虫 (著名写手)


zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢 5-1 23:03
把那个文件夹里面的文件名都发上来
8楼2009-05-01 18:48:05
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):多谢 5-1 23:02
看看是不是cpu已经没有利用率了,
可能能量偏差太大出错,步长改为0.5试试
2楼2009-04-28 18:31:11
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)

CPU使用率确实为0,改步长为0.5后, 运行到 16084fs 后又不动了,可不可能是其他什么原因?望指教!!谢谢!
下面是status.txt中的部分信息:
Operation: dynamics
  Temperature    295K
  Step         32168
  Sim Time     16084fs
  CPU Time   0:19:37
3楼2009-04-28 20:38:19
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)

Materials.Studio 4.0
在个人计算机上计算
5楼2009-04-28 22:12:52
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