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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】discover运行问题，请高手帮忙，谢谢！！！
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】discover运行问题，请高手帮忙，谢谢！！！

在运行Discover—Dynamics时，具体参数选择为：
ensemble---NVE；
Temperature—300K；
number of steps——200000；
time step—1.0；
dynamics time—200.0；
save—full；
frame output every—250
点击Run后，可以运行。
但是当运行一段时间后就停留在那一步不动了，无法进行后面的计算，而Jobs explorer中status栏仍显示为：running。
下面是status.txt中部分信息，从这之后等了40多分钟后还是这样，毫无进展，也没提示错误：
Operation: dynamics
  Temperature    312K
  Step         27068
  Sim Time     27068fs
  CPU Time   0:15:37
不知道是什么原因，请高手指点，谢谢！！！
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1楼 2009-04-28 16:42:45
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qasd

木虫 (著名写手)
★
zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢，欢迎常来 5-14 23:57
分子包含的原子数越多，越难得到能量最低构象
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17楼2009-05-15 14:13:14
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):多谢 5-1 23:02
看看是不是cpu已经没有利用率了，
可能能量偏差太大出错，步长改为0.5试试
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2楼2009-04-28 18:31:11
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)
CPU使用率确实为0，改步长为0.5后， 运行到 16084fs 后又不动了，可不可能是其他什么原因？望指教！！谢谢!
下面是status.txt中的部分信息：
Operation: dynamics
  Temperature    295K
  Step         32168
  Sim Time     16084fs
  CPU Time   0:19:37
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3楼2009-04-28 20:38:19
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laohaoren2802

银虫 (正式写手)
Materials.Studio 4.0
在个人计算机上计算
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5楼2009-04-28 22:12:52
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