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ychh521

木虫 (小有名气)


[资源] 浅谈核酸染料,最佳EB替代品

对于这个问题,实验室一直在讨论,各种核酸染料各有优缺,到底应该选择哪一个实在是个让人头疼的问题!

因为工作需要,我们室的核酸电泳量相当巨大,每天都要不停的跑啊跑。。所以对这个EB替代品问题就比较关心,基本上市面上的所有核酸染料都买来试过了。

其实做核酸电泳 替代EB的主要原因无非两条:
1 保证对身体低危害;
2 在不影响EB的效果的前提下,可以更加稳定,敏感度更高,以适应高精确度的实验

以这两条原则为准绳,我们做到现在,只有两个产品可以达到 sybr green ,和 gelred
无论是危害性,实验效果都可以达到要求。
但是鉴于实验室已经被污染,并且这两个产品的价格要比EB高出许多,所以现在仍然在使用EB。
想立刻更换EB替代品,希望大家根据自己的经验,给些建议,师弟在此不胜感激!

补充一个小知识,AO又称丫叮橙,剧毒致癌物质,也可以做DNA和RNA电泳。它在做双链DNA电泳时呈现绿色荧光,单链则为红色荧光。

现在有不少国内EB替代品就是用AO(丫叮橙)为原料,实验效果虽然不如EB,这个暂且放在一边不说,就是毒性也够吓人的!无是从健康角度还是实验效果而言都无法与EB媲美!
希望大家谨慎选择,剧我所知,国内的EB替代品,核酸染料全是用AO丫叮橙调制!

因为所有的染料我都用过,这些国内的EB替代品,它们跟AO丫叮橙的实验结果惊人的相似!大家不妨都拿来试用一下看看结果。

在毒性认证这方面我可以说我们应该很重洋媚外!

没有人愿意拿自己5年甚至10以后的身体健康来做赌注

我们实验室刚用sybr green 替代EB,可能是刚用条件不是摸的透彻,跑出的不如EB漂亮。
请问你们使用sybr green 的步骤?
不是要预染10MIN,染长时间有影响吗?
实验室开空调,是否影响胶浓缩时间?

是不如eb漂亮,有时候还不准,跑一组,条带都成锯齿了,不过比EB敏感多了,用核酸染料染的也可以用凝胶成像仪看,也可以拍,

电压越高,条带越乱,有时候会误认为是非特异性扩增,后又跑下EB,发现是目的条带,现在还没想出为什么.

不同公司的sybr现在效果差别很大!产品相当乱。
建议大家可以试试 gelred ,各方面效果都很出色,还可以免费试用的,不过不知道现在还发不发免费装


biospace wrote:
补充一个小知识,AO又称丫叮橙,剧毒致癌物质,也可以做DNA和RNA电泳。它在做双链DNA电泳时呈现绿色荧光,单链则为红色荧光。

现在有不少国内EB替代品就是用AO(丫叮橙)为原料,实验效果虽然不如EB,这个暂且放在一边不说,就是毒性也够吓人的!无是从健康角度还是实验效果而言都无法与EB媲美!
希望大家谨慎选择,剧我所知,国内的EB替代品,核酸染料全是用AO丫叮橙调制!

因为所有的染料我都用过,这些国内的EB替代品,它们跟AO丫叮橙的实验结果惊人的相似!大家不妨都拿来试用一下看看结果。

在毒性认证这方面我可以说我们应该很重洋媚外!

没有人愿意拿自己5年甚至10以后的身体健康来做赌注


看来以后接触goldiew还是小心点好
Gelred是哪家公司买呢?价格多少?

天根又推出了一个叫GeneGreen的染料,说是属于花青类染料,比EB毒性低,无致癌性,灵敏度比EB高10倍.紫外发射绿色荧光.拿了个试用装.不知道是不是楼上所说的AO(丫叮橙)?
gelred价格是很高啊,将近一千块了.

只要有上边所说的那个特性就应该是丫叮橙了,所以建议大家谨慎操作
gelred价格是比较高的,奢侈的实验室才用的起了,不过送我们的试用装还没用完呢

请问楼上是在哪申请的试用装?

www.probes.com.cn
很久以前的活动了,你自己找找看吧

做电泳这么多年,其实还是EB最好,没毒就完美了

强力推荐大家使用gelred,效果没的说,另外我看了报价,竟然比美金报价格还便宜,相当划算的EB替代品

记得我们实验室用过赛百盛,跑的效果还是不错的。染DNA是绿色荧光,不知道和上面说的是不是一样的东西,我只知道商品名,呵呵

我刚到实验室不久,听说是用一种叫"GENEFINDER"的EB替代品,不知道和以上大家说的有无联系,要是也有毒性的话我以后可要小心了.

我现在还是从goldiew用回EB了.没办法啊,EB灵敏度高而且便宜.安全自己多注意了,戴两层一次手套和一层橡胶手套可以了吧.

其实我觉得核酸染料最好还是不要直接接触,不管现在有毒还是没毒的.
因为从目前核酸染料的原理来讲,都是插入DNA,被刚性力束缚.当一定波长的光诱导以后,无法通过基团旋转来释放多余能量,只能通过电子的跃迁来平衡,所以发出荧光.
还是少直接接触的好.

The effectie ingredient in Goldiew is acridine orange (extremely cheap from Aldrich or Sigma at ~100g/$140!)
Acridine orange is a known gel stain since 1970s (“Analysis of single- and double-stranded nucleic acids on polyacrylamide and agarose gels by using glyoxal and acridine orange”. Proc Natl Acad Sci U S A. 1977 No;74(11):4835-8.
Acridine orange is a highly toxic and known mutagen!

Selected list of papers on acridine orange toxicity:
Web, RB. Mutat Res. 1984 Jul;137(1):1-6.
Wugmeister, M. Yale J Biol Med. 1983 Jan-Feb;56(1):9-13.
Martin, SE. Mutat Res. 1981 Jun;82(1):41-6.
Ashad, R. Letters in Applied Microbiology 2006, 42:94.

goldiew ,genefinder等这些染料其实都是上边所说的 acridine orange (丫啶橙),毒性很大,如果大家现在用的是这两种东西就建议还是换回eb吧!!
现在已经真相大白,

建议不要再为节省那点银子而做无畏的牺牲了!!

只要有上边所说的那个特性就应该是丫叮橙了,所以建议大家谨慎操作
gelred价格是比较高的,奢侈的实验室才用的起了,不过送我们的试用装还没用完呢

请问是哪个特性啊

只要有上边所说的那个特性就应该是丫叮橙了,所以建议大家谨慎操作
gelred价格是比较高的,奢侈的实验室才用的起了,不过送我们的试用装还没用完呢

请问是哪个特性啊

这个特性:
它在做双链DNA电泳时呈现绿色荧光,单链则为红色荧光

还想关注这个问题

赛百盛公司的Goldiew核酸染料,说明书上写的是没有毒害,我们实验室一直在用,效果还是不错的。

别用Goldiew了,剧毒!!!强烈推荐gelred,如果不是价格问题就买吧,我有个导师刚从美国回来,那边做课题基本都在用gelred出的结果了,效果非常好,至于毒性,大家就擦亮双眼吧,这些尖端的东西还是重洋点好,毕竟老美在环保这方面可是比我们要重视的多的

GelRed的确比较不错。

我这里有翻译的中文说明书,感兴趣的可以看看。

GelRed核酸凝胶染色剂中文说明书(把@换成.):

http://www@mylab@com@cn/admin/UploadDriers/2007425112742365.pdf

是不是丫锭橙跑个电泳就知道了,丫锭橙染色效果不如EB的,目前比EB好的荧光染料的毒型都低得多,比如GELRED,GELGREEN,SYBR GREEN,GENESEARCH,

我们实验室用的是Gelred的,还是在我的极力推荐下替换的,老板也很爽快,竟然一下子就答应了,呵呵!
是上海开放公司代理的,其它地方有办事处,可以直接联系的。
500ul大概850左右,买多还可以讲讲价格的。可以泡胶,液可以直接加在胶里。
我们一般都是泡胶的,效果很好!和eb泡胶一样方便,且稳定性要比eb好,不用担心分解的。

***新出了一款花箐核酸染料,价格不错,比EB敏感,挺合适的
首页有介绍
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hongkaichen

金虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

gelred确实没EB跑的好看~
4楼2009-04-28 20:43:07
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anik

银虫 (正式写手)


好贴,学习中。。。。
2楼2009-04-28 18:47:33
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hihoney

铁杆木虫 (职业作家)


EB,一道跳不过去的坎。
3楼2009-04-28 18:50:52
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