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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 做质谱的时候没有目标物种蛋白组数据库怎么鉴定质谱得到的结果
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lyb853200611

铁虫 (初入文坛)

[求助] 做质谱的时候没有目标物种蛋白组数据库怎么鉴定质谱得到的结果 已有1人参与

想鉴定昆虫某组织的蛋白，但是做完质谱发现没有该物种的蛋白组数据库，只有基因组，该怎么分析得到的质谱结果呢
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1楼 2018-11-27 10:35:42
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匿名

用户注销 (正式写手)
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2楼2018-11-27 10:44:57
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1034714749

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
没有数据对比只能de novo测序了，一般手段就是用多种蛋白酶水解目的蛋白质，对比如用蛋白酶A，B，C和D对蛋白质酶切，然后分别对A，B，C和D酶切的片段打质谱，然后拼接，只要所有的氨基酸都被覆盖，最后结果是很准确的
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3楼2018-11-27 14:25:27
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lyb853200611

铁虫 (初入文坛)
谢谢大家，但是de novo测序老板怕是不同意
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4楼2018-11-28 09:53:25
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