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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物化学 » 酶催化问题！
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wangjy_026

新虫 (小有名气)

[交流] 酶催化问题！ 已有2人参与

酶跟底物特意结合后被酶分子的催化部位催化，那么酶的结合部位跟催化部位是要挨着吗？否则是怎么催化的呢？

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1楼 2018-11-18 22:29:47
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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-11-20 10:10:10
酶的结合部位跟催化部位不一定要挨着。例如Cas9是DNA酶，结合后会把切DNA的催化部位带过来，反正一个分子上，远也远不到哪去。。晃悠晃悠，不小心碰上，就催化了
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Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
2楼2018-11-19 00:27:13
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wangjy_026

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by drwhoknowss at 2018-11-19 00:27:13
酶的结合部位跟催化部位不一定要挨着。例如Cas9是DNA酶，结合后会把切DNA的催化部位带过来，反正一个分子上，远也远不到哪去。。晃悠晃悠，不小心碰上，就催化了

哦，谢谢啦，学习了，一直被困惑。目前我在做纳米纤维模拟酶自催化，就是可以把自己水解，我的催化基团亲水应该暴露在纤维表面，但是被切的那段应该是疏水组装在纤维内部，所以我一直在想能不能实现自催化，感觉够不着啊

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3楼2018-11-19 12:53:31
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1034714749

铜虫 (小有名气)
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-11-20 10:10:22
在氨基酸的顺序上可能差很远呢，但在空间结构上一般比较靠近，但也不一定挨着。做过脂肪酶和磷脂酶的结构分析，目测都是这个结论
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4楼2018-11-19 15:22:36
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wangjy_026

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 1034714749 at 2018-11-19 15:22:36
在氨基酸的顺序上可能差很远呢，但在空间结构上一般比较靠近，但也不一定挨着。做过脂肪酶和磷脂酶的结构分析，目测都是这个结论

那有可能结合部位在内部疏水区，而催化基团是谷氨酸啊组氨酸之类的亲水氨基酸暴露在外的吗？

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5楼2018-11-19 21:44:45
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1034714749

铜虫 (小有名气)
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引用回帖:
5楼: Originally posted by wangjy_026 at 2018-11-19 21:44:45
那有可能结合部位在内部疏水区，而催化基团是谷氨酸啊组氨酸之类的亲水氨基酸暴露在外的吗？
...

结合部位在内部的情况比较少见，至少印象里没多少。理论上是可行的，比如底物可能是很小的分子做表面催化，但也不会太靠内，这样很影响结合
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6楼2018-11-20 16:38:05
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wangjy_026

新虫 (小有名气)
哦，非常感谢，我是看书上说会结合在非极性部位，所以觉得会结合在里面的疏水空腔之类的

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7楼2018-11-22 12:39:10
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wangjy_026

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 1034714749 at 2018-11-20 16:38:05
结合部位在内部的情况比较少见，至少印象里没多少。理论上是可行的，比如底物可能是很小的分子做表面催化，但也不会太靠内，这样很影响结合...

能加一个qq吗？还是有点疑惑的，谢谢，我的号码是948131396，或者我加你也行。我是南开大学毕业的博士，现在在天津医科大学青椒

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8楼2018-11-22 15:48:32
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wangjy_026

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 1034714749 at 2018-11-20 16:38:05
结合部位在内部的情况比较少见，至少印象里没多少。理论上是可行的，比如底物可能是很小的分子做表面催化，但也不会太靠内，这样很影响结合...

非常感谢，我是看书上说会结合在非极性部位，所以觉得会结合在里面的疏水空腔之类的，是这样吗？

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9楼2018-11-24 12:03:52
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